Epidemiologia fungiei într-un spital de boli infecțioase din Mexico City: A 10-year retrospective review

Abstract

Epidemiologia infecțiilor fungice invazive s-a schimbat recent la populațiile imunodeprimate ca urmare a infecției cu HIV, a transplantului de organe, a chimioterapiei și la pacienții vârstnici. Diagnosticul infecțiilor fungice invazive prin cultură este prelungit, deoarece ciupercile se dezvoltă lent in vitro. am dorit să estimăm frecvența diagnosticelor de micoze stabilite prin laboratorul de micologie clinică în ultimii 10 ani; printr-un studiu retrospectiv; datele au fost obținute din registrul pacienților din laboratorul de laborator al Spitalului de Boli Infecțioase, din registrul de laborator al pacienților cu un izolat fungic sistemic între 2005 și 2014. Au fost identificate o sută treizeci și două (132) de infecții fungice sistemice. Acestea au fost mai răspândite la bărbați, în grupa de vârstă cuprinsă între 20 și 59 de ani și la pacienții cu diagnostic de SIDA. Agenții cel mai frecvent izolați au aparținut genului Candida și alții, cum ar fi Histoplasma sp., Cryptococcus sp., Aspergillus sp. , și Coccidioides sp. Dintre toate culturile de sânge și măduvă osoasă primite, 17,9% au avut evoluție fungică; dintre acestea, în 70% din cazuri a fost prin hemoculturi. În general, agenții fungici nu au fost suspectați din punct de vedere diagnostic. Am identificat că Șaizeci la sută (60%) din fungii s-au dezvoltat la pacienții cu SIDA, urmați de pacienții cu sepsis. Cei mai frecvenți agenți au aparținut genului Candida, predominând specia albicans. Aceștia au fost mai frecvent identificați prin hemocultură decât prin cultura măduvei osoase. Infecțiile fungice invazive nu au urmat un tipar clinic obișnuit și nu sunt ușor de recunoscut.

Introducere

Epidemiologia infecțiilor invazive a suferit modificări recente în ceea ce privește incidența infecțiilor fungice la populațiile imunosupresate de virusul imunodeficienței umane (HIV), transplant de organe, chimioterapie și la pacienții vârstnici. Literatura de specialitate descrie un număr semnificativ de infecții fungice sistemice datorate unor microorganisme filamentoase, asemănătoare drojdiilor sau dimorfice endemice. 1

Trebuie evidențiate două categorii de infecții fungice: cele de origine oportunistă și cele de origine endemică. Infecțiile endemice sunt considerate primare, iar susceptibilitatea la infecție depinde de expunerea geografică la ciupercă în habitatul său natural. Acest lucru este exemplificat de accesul gazdei prin căile respiratorii la organisme precum Histoplasma capsulatum, Coccidioides immitis , și Blastomyces dermatitidis.2-5

Cei mai bine cunoscuți agenți care duc la micoze oportuniste includ Candida albicans, Cryptococcus neoformans, Aspergillus fumigatus , și Pneumocystis jirovecii care invadează de obicei căile respiratorii, tractul gastrointestinal sau dispozitivele intravasculare. 6 În ceea ce privește frecvența acestor infecții la unele populații imunocompromise, incidența anuală estimată a candidozei a fost raportată ca fiind de 72 până la 290 de infecții la un milion, 30 până la 66 de infecții la un milion în cazul lui C. neoformans și 12 până la 34 de infecții la un milion pentru Aspergillus sp.7

Peste 17 specii diferite de Candida au fost identificate ca agenți etiologici ai candidozei sistemice. Cele mai frecvente specii sunt C. albicans, C. glabrata, C. parapsilosis , și C. tropicalis.8 , 9 În ultimele două decenii, candidoza a crescut la pacienții spitalizați și la pacienții ambulatoriali cu catetere permanente de lungă durată. 10 , 11 Candidemia este cea mai frecventă cauză a infecțiilor fungice invazive la pacienții spitalizați și a patra cauză principală de infecție fungică în mediul de terapie intensivă. 12 , 13 Alte infecții, cum ar fi criptocococoza, histoplasmoza și coccidiomicoza, au crescut, de asemenea, în frecvență la populațiile imunodeprimate. Criptocococoza este o infecție oportunistă frecventă, nu numai la pacienții cu HIV, ci și la pacienții cu transplant de organe solide și de celule stem. 14 , 15 Această creștere progresivă a infecțiilor fungice invazive a avut un impact asupra morbidității și mortalității pacienților afectați; 16 în plus, răspunsul la tratament în contextul rezistenței antifungice intrinseci a devenit o problemă în gestionarea acestor infecții și compromite și mai mult ratele de mortalitate asociate. 17

Pe baza acestei perspective, este necesar să se recunoască tendințele actuale și incidența agenților fungici patogeni și, astfel, să se orienteze eventual clinicianul în ceea ce privește diagnosticul și terapia. În general, ne bazăm pe date bazate pe constatările microbiologice și pe caracteristicile clinice ale gazdei obținute din diferite studii și instituții. Un studiu a raportat 983 de cazuri de infecții fungice invazive dovedite și 875 de cazuri probabile pe o perioadă de 5 ani, în care aspergiloza invazivă a fost cel mai frecvent diagnostic (43% din cazuri), urmată de candidoza invazivă în 28% și de zigomicoză în 8%, 17 deși aceste rezultate au variat în funcție de instituția medicală. În 2002, Organizația Europeană pentru Cercetarea și Tratamentul Cancerului și Micozelor (EORTC) a definit factorii care stabilesc clasificarea infecțiilor ca fiind dovedite, probabile sau posibile. 18 , 19

Considerăm că este important să cunoaștem frecvența diagnosticului de micoză pe baza fișei pacientului din Laboratorul de Micologie al Spitalului, înregistrată în ultimii 10 ani Boli Infecțioase.

Material și metode

Acesta este un studiu retrospectiv, descriptiv. Datele au fost obținute din registrul de evidență a pacienților din laboratorul Spitalului de Boli Infecțioase, din Mexico City, între ianuarie 2005 și decembrie 2014. Hemoculturile au fost procesate cu sistemele automate BACTEC ® 9240 (Becton Dickinson Diagnostic Systems, Sparks, MD, SUA) și Bact/ALERT ® 3D (bioMérieux, Franța). Identificarea drojdiilor a fost realizată cu ajutorul procedurilor fenotipice, inclusiv însămânțarea în agar cromogenic și testarea biochimică cu cartele comerciale Vitek ® (bioMérieux, Franța). Ciupercile filamentoase au fost identificate prin caracteristicile lor macro și micromorfologice. 20

În scopul studiului, fungemia a fost definită ca fiind creșterea ciupercilor în sânge, măduvă osoasă sau biopsie; aceasta s-a bazat pe definiția micozelor sistemice dovedite, stabilită prin consens internațional. 18

Analiză statistică

Analiza generală a datelor și testarea normalității au fost efectuate cu metode descriptive care măsoară tendințele, frecvențele simple și distribuția procentuală a caracteristicilor generale ale subiecților studiului.

Considerații etice

Acest studiu s-a bazat pe datele obținute din registrul secției de micologie, astfel încât nu a fost pusă în pericol nici o manipulare a variabilelor care ar putea compromite autonomia pacientului sau care să afecteze principiul de beneficență- nonmaleficență a individului. Au fost respectate toate prevederile Codului Sănătății în investigație și ale Declarației de la Helsinki revizuite în cadrul celei de-a 64-a Adunări Generale desfășurate la Fortaleza, Brazilia, în octombrie 2013; Declarația s-a adresat în principal medicilor implicați în cercetarea pe subiecți umani și s-a axat în principal pe confidențialitatea datelor. Mai mult decât atât, au fost îndeplinite și statutele Legilor Generale ale Sănătății în ceea ce privește Cercetarea în Sănătate, articolul 17: acest studiu nu a prezentat niciun risc pentru pacienți.

Rezultate

Am efectuat un studiu descriptiv bazat pe înregistrările fungice ale laboratorului de micologie medicală între ianuarie 2005 și decembrie 2014; au fost identificate o sută treizeci și două (132) de infecții sistemice de origine fungică. În general, au fost primite patru fiole de hemocultură de la fiecare pacient și am inclus o singură cultură pozitivă pentru studiu, chiar dacă au existat mai multe hemoculturi consecutive în care a crescut același organism. Infecțiile au fost mai frecvente la bărbați (75,8%), iar cea mai mare frecvență a cazurilor a fost observată în grupul cu vârste cuprinse între 20 și 59 de ani (medie 39,4 ani, deviație standard (SD) 13,2 ani). În grupul pediatric cu vârsta sub 16 ani, infecția a fost depistată la o vârstă medie de 52,8 luni (SD 54,1 luni); în 26 de cazuri, vârsta pacientului nu a fost disponibilă. Boala subiacentă a fost HIV/SIDA în 63% din cazuri, urmată de sepsis, diabet zaharat și boli hematologice (tabelul 1 ).

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

et al.

.

.