Epidemiologia fungemii w szpitalu chorób zakaźnych w mieście Meksyk: A 10-year retrospective review

Abstract

Epidemiologia inwazyjnych zakażeń grzybiczych uległa ostatnio zmianie w populacjach o obniżonej odporności w wyniku zakażenia HIV, transplantacji narządów, chemioterapii oraz u pacjentów w podeszłym wieku. Diagnostyka inwazyjnych zakażeń grzybiczych za pomocą hodowli jest wydłużona, ponieważ grzyby rosną powoli w warunkach in vitro. chcieliśmy oszacować częstość rozpoznań fungemii ustalonych za pośrednictwem Klinicznej Pracowni Mikologicznej w ciągu ostatnich 10 lat; poprzez badanie retrospektywne; dane uzyskano z laboratoryjnego rejestru pacjentów w Szpitalu Zakaźnym pacjentów z ogólnoustrojowym izolatem grzybiczym w latach 2005-2014. Zidentyfikowano sto trzydzieści dwa (132) układowe zakażenia grzybicze. Występowały one częściej u mężczyzn, w grupie wiekowej od 20 do 59 lat oraz u pacjentów z rozpoznaniem AIDS. Najczęściej izolowane czynniki należały do rodzaju Candida oraz innych, takich jak Histoplasma sp., Cryptococcus sp., Aspergillus sp. i Coccidioides sp. Spośród wszystkich otrzymanych posiewów krwi i szpiku kostnego 17,9% miało rozwój grzybów, z czego w 70% przypadków był to posiew krwi. Ogólnie, czynniki grzybicze nie były podejrzewane diagnostycznie. Stwierdzono, że 60% (60%) grzybic rozwinęło się u chorych na AIDS, a następnie u chorych z sepsą. Najczęstsze czynniki chorobotwórcze należały do rodzaju Candida, głównie do gatunku albicans. Częściej identyfikowano je na podstawie posiewu krwi niż szpiku kostnego. Inwazyjne zakażenia grzybicze nie przebiegają według typowego schematu klinicznego i nie są łatwo rozpoznawalne.

Wprowadzenie

Epidemiologia inwazyjnych zakażeń uległa ostatnio zmianom pod względem częstości występowania zakażeń grzybiczych w populacjach poddanych immunosupresji z powodu ludzkiego wirusa niedoboru odporności (HIV), transplantacji narządów, chemioterapii i u pacjentów w podeszłym wieku. W piśmiennictwie opisano znaczną liczbę układowych zakażeń grzybiczych wywołanych przez nitkowate, drożdżopodobne lub endemiczne mikroorganizmy dimorficzne. 1

Należy zwrócić uwagę na dwie kategorie zakażeń grzybiczych: zakażenia pochodzenia oportunistycznego i endemicznego. Infekcje endemiczne uważane są za pierwotne, a podatność na zakażenie zależy od geograficznej ekspozycji na grzyba w jego naturalnym środowisku. Przykładem tego jest dostęp gospodarza przez drogi oddechowe do takich drobnoustrojów, jak Histoplasma capsulatum, Coccidioides immitis i Blastomyces dermatitidis.2-5

Do lepiej poznanych czynników prowadzących do grzybic oportunistycznych należą Candida albicans, Cryptococcus neoformans, Aspergillus fumigatus i Pneumocystis jirovecii, które zwykle atakują drogi oddechowe, przewód pokarmowy lub urządzenia wewnątrznaczyniowe. 6 Jeśli chodzi o częstość występowania tych zakażeń w niektórych populacjach o obniżonej odporności, szacowana roczna częstość występowania kandydemii wynosi 72 do 290 zakażeń na milion, 30 do 66 zakażeń na milion w przypadku C. neoformans i 12 do 34 zakażeń na milion w przypadku Aspergillus sp.7

Ponad 17 różnych gatunków Candida zostało zidentyfikowanych jako czynniki etiologiczne kandydozy układowej. Najczęstsze gatunki to C. albicans, C. glabrata, C. parapsilosis i C. tropicalis.8 , 9 W ostatnich dwóch dekadach kandydemia wzrosła u pacjentów hospitalizowanych i u pacjentów ambulatoryjnych z długotrwałymi cewnikami. 10 , 11 Kandydemia jest najczęstszą przyczyną inwazyjnych zakażeń grzybiczych u pacjentów hospitalizowanych i czwartą główną przyczyną zakażeń grzybiczych na oddziałach intensywnej terapii. 12 , 13 Inne infekcje, takie jak kryptokokoza, histoplazmoza i kokcydiomikoza, również zwiększyły swoją częstość w populacjach z immunosupresją. Kryptokokoza jest częstym zakażeniem oportunistycznym, nie tylko u pacjentów z HIV, ale także u biorców przeszczepów narządów litych i komórek macierzystych. 14 , 15 Ten postępujący wzrost inwazyjnych zakażeń grzybiczych wpłynął na chorobowość i śmiertelność dotkniętych nimi pacjentów; 16 co więcej, odpowiedź na leczenie w kontekście wewnętrznej oporności przeciwgrzybiczej stała się problemem w zarządzaniu tymi zakażeniami i dodatkowo pogarsza związane z nimi wskaźniki śmiertelności. 17

Z tej perspektywy konieczne jest poznanie aktualnych tendencji i częstości występowania patogennych czynników grzybiczych, a tym samym ewentualne ukierunkowanie klinicysty w zakresie diagnostyki i terapii. Ogólnie rzecz biorąc, opieramy się na danych opartych na wynikach badań mikrobiologicznych i charakterystyce klinicznej gospodarza, uzyskanych z różnych badań i instytucji. W jednym z badań opisano 983 przypadki potwierdzonej inwazyjnej infekcji grzybiczej i 875 prawdopodobnych przypadków w okresie 5 lat, w których najczęstszym rozpoznaniem była inwazyjna aspergiloza (43% przypadków), następnie inwazyjna kandydoza w 28% i zygomikoza w 8%, 17 chociaż wyniki te różniły się w zależności od instytucji medycznej. W 2002 roku European Organization for Research and Treatment of Cancer and Mycosis (EORTC) określiła czynniki pozwalające na klasyfikację zakażeń jako udowodnione, prawdopodobne lub możliwe. 18 , 19

Uważamy za istotne poznanie częstości rozpoznania fungemii na podstawie rejestru pacjentów w Szpitalnej Pracowni Mikologicznej, zarejestrowanego w ciągu ostatnich 10 lat Choroby Zakaźne.

Materiał i metody

Jest to badanie retrospektywne, opisowe. Dane uzyskano z rejestru pacjentów w laboratorium Szpitala Zakaźnego, w mieście Meksyk, w okresie od stycznia 2005 do grudnia 2014 roku. Posiewy krwi były przetwarzane za pomocą automatycznych systemów BACTEC ® 9240 (Becton Dickinson Diagnostic Systems, Sparks, MD, USA) i Bact/ALERT ® 3D (bioMérieux, Francja). Identyfikację drożdży prowadzono z zastosowaniem procedur fenotypowych, w tym posiewu na agar chromogenny oraz badań biochemicznych z użyciem komercyjnych kart Vitek ® (bioMérieux, Francja). Grzyby strzępkowe identyfikowano na podstawie cech makro- i mikromorfologicznych. 20

Dla celów badania fungemię zdefiniowano jako wzrost grzybów we krwi, szpiku kostnym lub biopsji; oparto się na definicji udowodnionych grzybic układowych ustalonej przez międzynarodowy konsensus. 18

Analiza statystyczna

Ogólną analizę danych i badanie normalności przeprowadzono metodami opisowymi, mierząc tendencje, częstości proste i rozkład procentowy ogólnych cech badanych.

Uwagi etyczne

Badanie opierało się na danych uzyskanych z rejestru Sekcji Mikologii, a więc nie doszło do manipulacji zmiennymi potencjalnie naruszającymi autonomię pacjenta lub wpływającymi na zasadę dobroczynności-niedobroczynności jednostki. Spełnione zostały wszystkie postanowienia Kodeksu Zdrowia w Investigation oraz Deklaracji Helsińskiej zweryfikowanej podczas 64 Zgromadzenia Ogólnego przeprowadzonego w Fortalezie w Brazylii w październiku 2013 roku; Deklaracja była skierowana głównie do lekarzy zaangażowanych w badania na ludziach i skupiała się przede wszystkim na poufności danych. Ponadto spełnione zostały również przepisy ogólnych ustaw zdrowotnych w zakresie badań w zdrowiu, artykuł 17: badanie to nie stwarzało ryzyka dla pacjentów.

Wyniki

Przeprowadziliśmy badanie opisowe na podstawie zapisów fungemii z medycznego laboratorium mikologicznego w okresie od stycznia 2005 roku do grudnia 2014 roku; zidentyfikowano sto trzydzieści dwie (132) infekcje ogólnoustrojowe pochodzenia grzybiczego. Generalnie od każdego pacjenta otrzymywano cztery fiolki z posiewem krwi, a do badania włączano pojedynczy dodatni posiew, nawet jeśli w więcej niż jednym kolejnym posiewie krwi wyhodowano ten sam drobnoustrój. Zakażenia występowały częściej u mężczyzn (75,8%), a największą częstość zachorowań obserwowano w grupie między 20. a 59. rokiem życia (średnio 39,4 lat, odchylenie standardowe (SD) 13,2 lat). W grupie dziecięcej poniżej 16 roku życia zakażenie wykryto w średnim wieku 52,8 miesiąca (SD 54,1 miesiąca); w 26 przypadkach nie udało się ustalić wieku pacjenta. Chorobą podstawową w 63% przypadków było HIV/AIDS, następnie sepsa, cukrzyca i choroby hematologiczne (tab. 1).

Tabela 1.

Charakterystyka i rozpoznania badanej populacji.

Charakterystyka . Częstość N 132 (%) .
Płeć
Kobieta 32 (24.2)
Mężczyzna 100 (75.8)
Grupa wiekowa
0 do 9 lat 41 (31.1)
10 do 19 lat 2 (1.5)
20 do 59 lat 81 (61.4)
60 i więcej lat 8 (6.1)
Choroba podstawowa
HIV/AIDS 83 (62.9)
Sepsa 28 (21.2)
Cukrzyca 11 (8.3)
Białaczka 3 (2.3)
Neutropenia 2 (1.5)
Chirurgia sercowo-naczyniowa 1 (0.8)
Zapalenie płuc 1 (0.8)
Przeszczep nerki CKD 1 (0.8)
Brak danych 2 (1,5)
Charakterystyka . Częstotliwość N 132 (%) .
Płeć
Kobieta 32 (24.2)
Mężczyzna 100 (75.8)
Grupa wiekowa
0 do 9 lat 41 (31.1)
10 do 19 lat 2 (1.5)
20 to 59 yrs 81 (61.4)
60 and above 8 (6.1)
Choroba podstawowa
HIV/AIDS 83 (62.9)
Sepsa 28 (21.2)
Cukrzyca 11 (8.3)
Białaczka 3 (2.3)
Neutropenia 2 (1.5)
Operacja układu krążenia 1 (0,8)
Zapalenie płuc 1 (0.8)
CKD przeszczep nerki 1 (0,8)
Brak danych 2 (1,5)

Tabela 1.

Charakterystyka i rozpoznania badanej populacji.

Charakterystyka . Częstość N 132 (%) .
Płeć
Kobieta 32 (24.2)
Mężczyzna 100 (75.8)
Grupa wiekowa
0 do 9 lat 41 (31.1)
10 do 19 lat 2 (1.5)
20 do 59 lat 81 (61.4)
60 i więcej lat 8 (6.1)
Choroba podstawowa
HIV/AIDS 83 (62.9)
Sepsa 28 (21.2)
Cukrzyca 11 (8.3)
Białaczka 3 (2.3)
Neutropenia 2 (1.5)
Chirurgia sercowo-naczyniowa 1 (0.8)
Zapalenie płuc 1 (0.8)
Przeszczep nerki CKD 1 (0.8)
Brak danych 2 (1,5)
Charakterystyka . Częstotliwość N 132 (%) .
Płeć
Kobieta 32 (24.2)
Mężczyzna 100 (75.8)
Grupa wiekowa
0 do 9 lat 41 (31.1)
10 do 19 lat 2 (1.5)
20 to 59 yrs 81 (61.4)
60 and above 8 (6.1)
Choroba podstawowa
HIV/AIDS 83 (62.9)
Sepsa 28 (21.2)
Cukrzyca 11 (8.3)
Białaczka 3 (2.3)
Neutropenia 2 (1.5)
Operacja układu krążenia 1 (0.8)
Zapalenie płuc 1 (0.8)
CKD przeszczep nerki 1 (0.8)
Brak danych 2 (1.5)

Najczęściej izolowanymi czynnikami były czynniki z rodzaju Candida (58/132), zwłaszcza Candida albicans , następnie Candida parapsilosis, Candida glabrata, Candida tropicalis . Zidentyfikowano również inne drożdżaki, takie jak kilka gatunków Cryptococcus. Wśród grzybów filamentujących stwierdzono Histoplasma capsulatum w 36 przypadkach, dwa gatunki Aspergillus sp. i dwa przypadki Coccidioides sp. (tabele 2 i 3).

Tabela 2.

Dystrybucja wg rodzaju i gatunku izolatów w hodowli fungemii oraz pochodzenie izolatów.

Gatunek gatunku . Częstotliwość N 132 (%) .
Candida albicans 25(18,9)
Candida parapsilosis 16(12,1)
Candida glabrata 7(5.3)
Candida tropicalis 6(4,5)
Candida sake 2(1,5)
Candida krusei 1(0.8)
Candida guillermondii 1(0,8)
Histoplasma capsulatum 36(27,3)
Cryptococcus neoformans 28(21.2)
Cryptococcus laurentis 1(0.8)
Cryptococcus albidus 1(0.8)
Cryptococcus uniguttulatus 1(0.8)
Coccidioides immitis 2(1,5)
Aspergillus fumigatus 1(0.8)
Aspergillus flavus 1(0.8)
Rhodotorula mucilaginosa 1(0.8)
Nocardia sp 1(0.8)
Geotrichum candidum 1(0,8)
Preparat posiewny
Posiew krwi 93(70.5)
Hodowla szpiku kostnego 38(28,8)
Biopsja 1(0,8)
Gatunek genus . Częstotliwość N 132 (%) .
Candida albicans 25(18,9)
Candida parapsilosis 16(12,1)
Candida glabrata 7(5.3)
Candida tropicalis 6(4,5)
Candida sake 2(1,5)
Candida krusei 1(0.8)
Candida guillermondii 1(0,8)
Histoplasma capsulatum 36(27,3)
Cryptococcus neoformans 28(21.2)
Cryptococcus laurentis 1(0.8)
Cryptococcus albidus 1(0.8)
Cryptococcus uniguttulatus 1(0.8)
Coccidioides immitis 2(1,5)
Aspergillus fumigatus 1(0,8)
Aspergillus flavus 1(0.8)
Rhodotorula mucilaginosa 1(0.8)
Nocardia sp 1(0.8)
Geotrichum candidum 1(0.8)
Posiew próbki
Posiew krwi 93(70.5)
Posiew szpiku kostnego 38(28,8)
Biopsja 1(0.8)

Tabela 2.

Rozkład wg rodzaju i gatunku izolatu w hodowli fungemii i pochodzenia izolatu.

Gatunek gatunek . Częstotliwość N 132 (%) .
Candida albicans 25(18,9)
Candida parapsilosis 16(12,1)
Candida glabrata 7(5.3)
Candida tropicalis 6(4,5)
Candida sake 2(1,5)
Candida krusei 1(0.8)
Candida guillermondii 1(0,8)
Histoplasma capsulatum 36(27,3)
Cryptococcus neoformans 28(21.2)
Cryptococcus laurentis 1(0.8)
Cryptococcus albidus 1(0.8)
Cryptococcus uniguttulatus 1(0.8)
Coccidioides immitis 2(1,5)
Aspergillus fumigatus 1(0.8)
Aspergillus flavus 1(0.8)
Rhodotorula mucilaginosa 1(0.8)
Nocardia sp 1(0.8)
Geotrichum candidum 1(0,8)
Preparat posiewny
Posiew krwi 93(70.5)
Hodowla szpiku kostnego 38(28,8)
Biopsja 1(0,8)
Gatunek genus . Częstotliwość N 132 (%) .
Candida albicans 25(18,9)
Candida parapsilosis 16(12,1)
Candida glabrata 7(5.3)
Candida tropicalis 6(4,5)
Candida sake 2(1,5)
Candida krusei 1(0.8)
Candida guillermondii 1(0.8)
Histoplasma capsulatum 36(27.3)
Cryptococcus neoformans 28(21.2)
Cryptococcus laurentis 1(0.8)
Cryptococcus albidus 1(0.8)
Cryptococcus uniguttulatus 1(0.8)
Coccidioides immitis 2(1,5)
Aspergillus fumigatus 1(0,8)
Aspergillus flavus 1(0.8)
Rhodotorula mucilaginosa 1(0.8)
Nocardia sp 1(0.8)
Geotrichum candidum 1(0.8)
Posiew próbki
Posiew krwi 93(70,5)
Posiew szpiku kostnego 38(28.8)
Biopsja 1(0,8)
Tabela 3.

Rozkład gatunków Candida wg roku i częstości występowania.

. . .

.

.

.

. 2005 . 2006 . 2007 . 2008 . 2009 . 2010 . 2011 . 2012 . 2013 . 2014 . Razem .
C albicans 3 5 2 0 2 0 1 2 6 4 25
C parapsilosis 2 2 1 1 0 1 2 4 2 1 16
C glabrata 1 2 0 1 0 0 0 1 2 0 7
C tropicalis 0 1 2 0 1 0 0 2 0 0 6
C sake 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 2
C krusei 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1
C guillermondi 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1
58

.

. 2005 . 2006 . 2007 . 2008 . 2009 . 2010 . 2011 . 2012 . 2013 . 2014 . Razem .
C albicans 3 5 2 0 . 2 0 1 2 6 4 25
C parapsilosis 2 2 1 1 . 0 1 2 4 2 1 16
C glabrata 1 2 0 1 0 0 0 1 2 0 7
C tropicalis 0 1 2 0 1 0 0 2 0 0 6
C sake 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 2
C krusei 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1
C guillermondi 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1
58

Tabela 3.

Rozkład gatunków Candida wg roku i częstości występowania.

. 2005 . 2006 . 2007 . 2008 . 2009 . 2010 . 2011 . 2012 . 2013 . 2014 . Razem .
C albicans 3 5 2 0 2 0 1 2 6 4 25
C parapsilosis 2 2 1 1 0 1 2 4 2 1 16
C glabrata 1 2 0 1 0 0 0 1 2 0 7
C tropicalis 0 1 2 0 1 0 0 2 0 0 6
C sake 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 2
C krusei 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1
C guillermondi 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1
58
. 2005 . 2006 . 2007 . 2008 . 2009 . 2010 . 2011 . 2012 . 2013 . 2014 . Razem .
C albicans 3 5 2 0 2 0 1 2 6 4 25
C parapsilosis 2 2 1 1 0 1 2 4 2 1 16
C glabrata 1 2 0 1 0 0 0 1 2 0 7
C tropicalis 0 1 2 0 1 0 0 2 0 0 6
C sake 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 2
C krusei 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1
C guillermondi 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1
58

Grzyby zidentyfikowano na podstawie posiewu krwi w 70.5% przypadków, a w posiewie szpiku kostnego w 29%; w 20% przypadków grzyby wyizolowano w dwóch różnych próbkach od tego samego pacjenta (krew i szpik kostny). Pod względem rozpoznań wstępnych 13% uznano za zakażenia kryptokokowe, a 43% oznaczono jedynie jako zespół gorączkowy.

Brakuje nam kompletnych zapisów dotyczących rodzaju hodowanych próbek w latach 2005-2008, mamy jedynie raport zidentyfikowanego wzrostu grzybów. W związku z tym oceniano wyłącznie dane dotyczące próbek z rozwojem grzybów, które wpłynęły do laboratorium od 2009 roku: 3227 próbek otrzymano na posiew krwi i szpiku kostnego, a rozpoznanie zakażenia ogólnoustrojowego na podstawie hodowli krwi ustalono w około 11% przypadków; izolaty grzybów w posiewach szpiku kostnego były obecne w 6% próbek (Tabela 4 ).

Tabela 4.

Roczny rozkład izolatów grzybów.

Rok . Ogółem liczba preparatów otrzymanych w mikologii (posiewy krwi i szpiku kostnego) . Pozytywne posiewy krwi (%) . Dodatnie posiewy szpiku kostnego (%) .
2009 509 8 (1.57) 7 (1.37)
2010 525 3 (0.57) 1 (0.19)
2011 473 4 (0.84) 6 (1.26)
2012 581 16 (2.75) 8 (1.37)
2013 571 17 (2.97) 10 (1.75)
2014 568 13 (2.28) 1 (0.17)
Razem 3227 61 (10.98) 33 (6.11)
Rok . Całkowita liczba próbek otrzymanych w mikologii (posiewy krwi i szpiku kostnego) . Pozytywne posiewy krwi (%) . Dodatnie posiewy szpiku kostnego (%) .
2009 509 8 (1.57) 7 (1.37)
2010 525 3 (0.57) 1 (0.19)
2011 473 4 (0.84) 6 (1.26)
2012 581 16 (2.75) 8 (1.37)
2013 571 17 (2.97) 10 (1.75)
2014 568 13 (2.28) 1 (0.17)
Total 3227 61 (10.98) 33 (6,11)

Tabela 4.

Roczny rozkład izolatów grzybów.

Rok . Ogółem liczba preparatów otrzymanych w mikologii (posiewy krwi i szpiku kostnego) . Pozytywne posiewy krwi (%) . Dodatnie posiewy szpiku kostnego (%) .
2009 509 8 (1.57) 7 (1.37)
2010 525 3 (0.57) 1 (0.19)
2011 473 4 (0.84) 6 (1.26)
2012 581 16 (2.75) 8 (1.37)
2013 571 17 (2.97) 10 (1.75)
2014 568 13 (2.28) 1 (0.17)
Razem 3227 61 (10,98) 33 (6,11)
Rok . Całkowita liczba próbek otrzymanych w mikologii (posiewy krwi i szpiku kostnego) . Pozytywne posiewy krwi (%) . Dodatnie posiewy szpiku kostnego (%) .
2009 509 8 (1.57) 7 (1.37)
2010 525 3 (0.57) 1 (0.19)
2011 473 4 (0.84) 6 (1.26)
2012 581 16 (2.75) 8 (1.37)
2013 571 17 (2.97) 10 (1.75)
2014 568 13 (2.28) 1 (0.17)
Total 3227 61 (10.98) 33 (6.11)

Dyskusja

Fungemia wiąże się z poważnym ryzykiem śmiertelności, szczególnie w kontekście światowej pandemii HIV. 21-23 W regionach takich jak Meksyk, gdzie endemiczne grzybice są powszechne, wpływ fungemii może być jeszcze większy. Chociaż w opublikowanej literaturze medycznej można znaleźć pewne dane epidemiologiczne dotyczące inwazyjnych zakażeń grzybiczych, uważamy, że czynniki takie jak miejscowe podejrzenie kliniczne i podejście diagnostyczne klinicysty mają zasadnicze znaczenie dla terminowego rozpoznania zakażeń pochodzenia endemicznego, o czym wspominali już inni. 24

Wyniki tego badania sugerują, że czynniki etiologiczne fungemii są podobne do tych opisywanych wcześniej w literaturze medycznej, jednak w naszym badaniu fungemia była związana głównie z HIV/AIDS, sepsą i cukrzycą, a nie z przeszczepem narządów. HIV/AIDS był czynnikiem predysponującym pacjentów do kryptokokozy, histoplazmozy i kokcydioidomikozy; zakażenia te miały ostrzejszy i cięższy przebieg, prawdopodobnie z powodu niskiej liczby komórek CD4 we krwi obwodowej. 25-27

W naszym badaniu większość grzybic była wywołana przez grzyby z rodzaju Candida, Histoplasma i Cryptococcus. Histoplasma była drugim najczęściej identyfikowanym grzybem, co prawdopodobnie wynika z jej endemiczności w Meksyku. Kandydemia wywołana przez grzyby z rodzaju non- albicans była prawdopodobnie wynikiem zmian epidemiologicznych wtórnych do profilaktyki przeciwgrzybiczej lub innych czynników wpływających na spektrum inwazyjnych patogenów grzybiczych, w tym stanu klinicznego pacjenta. Współistniejące nowotwory złośliwe lub neutropenia, operacje przewodu pokarmowego, wcześniactwo lub zaawansowany wiek; obecność cewników wenętrznych, stosowanie antybiotyków o szerokim spektrum działania, niewydolność nerek, kolonizacja przez Candida , hospitalizacja na oddziale intensywnej terapii i stosowanie żywienia pozajelitowego, wszystkie znane czynniki zwiększające ryzyko kandydemii i aspergilozy. 6 , 14 , 28 Według częstości występowania, gatunki Candida zidentyfikowane w tym badaniu to: C. albicans, C. parapsilosis, C. glabrata i C. tropicalis , wzór podobny do tego, który zidentyfikowano w innych publikacjach. 2 , 29

Czułość diagnostyczna posiewów krwi jest niska (50%), ponieważ obecność żywych organizmów we krwi lub płynach oraz objętość pobranej próbki krwi mają zasadnicze znaczenie dla pomyślnego wzrostu. Ponadto, hodowla jest powolna, wymaga do czterech tygodni na wzrost, a do identyfikacji gatunku potrzeba kilku dni. Hodowle muszą być czyste w celu identyfikacji fenotypowej. 31-33

Pomimo że postęp techniczny w immunodiagnostyce może zapewnić szybką diagnostykę zakażeń grzybiczych, nadal ma ona ograniczenia, takie jak brak odpowiedzi przeciwciał u pacjentów z obniżoną odpornością, co może prowadzić do błędnego rozpoznania. Niniejsze doniesienie potwierdza, że posiewy krwi są częścią procedur przesiewowych wymaganych w diagnostyce zakażeń u pacjentów z gorączką z obniżoną odpornością. Konwencjonalne techniki mikrobiologiczne i histologiczne są nadal podstawą diagnostyki grzybiczej, szczególnie w krajach, w których rozwój techniki diagnostycznej nie jest powszechnie dostępny.

Podziękowania dla lekarzy, pielęgniarek i personelu laboratoryjnego Szpitala Zakaźnego.

Finansowanie

Nie uzyskano zewnętrznego źródła finansowania tego badania.

Deklaracja interesów

Autorzy nie zgłaszają konfliktu interesów. Autorzy ponoszą wyłączną odpowiedzialność za treść i sposób napisania pracy.

Fidkin
SK

Zmieniające się oblicze zakażeń grzybiczych w placówkach ochrony zdrowia

.

Clin Infect Dis
2005
41
1455
1460

.

Parish
JM

Blair
JE

Coccidioidomycosis
Mayo Clin Proc
2008

.

83
343
349

Kauffman
CA

Mikozy endemiczne: blastomykoza, histoplazmoza i sporotrychoza
Infect Dis Clinic N Am
2006
20
645
662

.

Chu
JH

Feudtner
C

Heyden
K

i wsp.

Hospitalizacja z powodu endemicznej grzybicy: a population-based national study
Clin Infect Dis
2006
42
822
825

.

Pfaller
MA

Diekema
DJ

.

Epidemiologia inwazyjnych grzybic w Ameryce Północnej
Crit Rev Microbiol
2010
36
1
53

Fishman
JA.

Infection in solid organ transplant recipients
N Engl J Med
2007
357
2601
2614

.

Zilberbeg
MD

Schorr
AF

Koller
MH

Secular trends in candidemia related hospitalization in United States, 2000-2005
Infect Control Hosp Epidemiol
2008
29
978
980

.

Richardson
M

Las-.Flör
C

Zmienna epidemiologia ogólnoustrojowych zakażeń grzybiczych
Clin Microb Infec
2008
14
5
24

.

Pfaller
MA

Diekema
DJ

Rzadkie i pojawiające się oportunistyczne patogeny grzybicze: obawa o oporność poza Candida albicans i Aspergillus fumigatus
J Clin Microbiol
2004
42
4419
4431

.

Ra
Hajjeh

Sofair
AN

Harrison
LH

i wsp.

Incidence of bloodstream infections due to Candida species and in vitro susceptibilities of isolates collected from 1998 to 2000 in a population based active surveillance program
J Clin Microbiol
2004
42
1519
1527

.

Galván
B

Mariscal
F

Epidemiologia kandydemii w OIT
Rev Iberoam Micol
2006

.

13
12
15

Egggiman
P

Garbino
P
Garbino
J

Pittet
D

Epidemiologia zakażeń wywołanych przez Candida species u krytycznie chorych pacjentów bez immunosupresji
Lancet Infect Dis
2003
3
685
702

Vazquez
JA

3.
Combination Antifungal Therapy for Mold Infections
Clin Infec Dis
2008
46
1889
1899

.

Ress
JR

Pinner
RW

Hajjeh
RA

i wsp.

Charakterystyka epidemiologiczna inwazyjnych zakażeń grzybiczych w rejonie Zatoki San Francisco. Area, 1992-1993: Results of population based Laboratory Active Surveillance
Clin Infect Dis
1998
27
1138
1147

Pfaller
MA

.

Epidemiologia grzybicy inwazyjnej
Clin Infect Dis
1998
27
1148

.

1150

Hernández
F

Cordova-.Martínez
E

Manzano-Gayosso
P

et al.

Częstotliwość występowania grzybic u pacjentów poddanych immunosupresji w szpitalu regionalnym w mieście Meksyk
Salud Pública de México
2003
45
455
460

.

Puzniak
L

Teustsch
S

Powderly
W

i wsp.

Czy epidemiologia szpitalnej kandydemii uległa zmianie?
Infect Control Hosp Epidemiolol
2004
25
624
626

.

Ascioglu
S

Rex
JH

Pauw
B

i in.

Defining opportunistic invasive fungal infections in immunocompromised patients with cancer and hematopoietic stem cell transplants: An international consensus
Clin Infect Dis
2002
34
7
14

.

De Pauw
B

Walsh
TJ

Donnelly
JP

i in.

Revised Definitions of invasive fungal disease from the European Organization for Research and Treatment of Cancer/Invasive Fungal Infections Cooperative Group and the National Institute of Allergy and Infectious Diseases Mycoses Study Group (EORTC/MSG) Consensus Group
Clin Infect Dis
2008

.

46
1813
1821

Freydiere
AM

.

Guinet
R

Boiron
P

Identyfikacja drożdży w laboratorium mikrobiologii klinicznej; metody fenotypowe
Med Mycol
2001
39
9
33

Armstrong-.James
D

Meintjes
G

Brown
G

Zaniedbana epidemia: infekcje grzybicze w HIV/AIDS
Trends in Microbiol
2014
22
120
127

.

Warnock
DW

Trends in the Epidemiology of Invasive Fungal Infections

.

Brown
GD

Meintjes
G

Kolls
J

i wsp.

Mikrozy związane z AIDS: droga naprzód
Trends Microbiol
2014
22
107
109

.

Colombo
Al

Tobón
A

Restrepo
A

i wsp.

Epidemiologia endemicznych ogólnoustrojowych zakażeń grzybiczych w Ameryce Łacińskiej
Med Mycol
2011
49
785
798

>.

Ellis
D

Marrito
D

Hajjeh
RA

et al.

Epidemiology surveillance of fungal infection
Med Mycol
2000
38
S1
173
182

.

Marques
SA

Robles
AM

Tortorano
AM

et al.

Mycoses associated with AIDS in the third world
Med Mycol
2000
38
S1
269
279

Patel
R.

Infections in recipients of kidney transplantants
Infect Dis Clin North Am
2001
15
901
951

.

Wey
SB

Mori
M

Pfaller
MA

i wsp.

Risk factors for hospital acquired candidemia a matched case control study
Arch Intern Med
1989
149
2349
2353

.

Pfaller
MA

Moet
GJ

Messer
SA

i wsp.

Candida bloodstream infections: porównanie rozmieszczenia gatunków i wzorów oporności na leki przeciwgrzybicze w izolatach pochodzących ze środowiska i izolatach szpitalnych w programie SENTRY Antimicrobial Surveillance Program, 2008-2009
Antimicrob Agents Chemother
2011
55
561
566

.

Pszenica
LJ

Obecna diagnostyka histoplazmozy
Trendy Microbiol
2003
11
488
494

.

Cockerill
FR

Wilson
JW

Vetter
A

i in.

Optymalne parametry badania posiewów krwi
Clin Infect Dis
2004
38
1724
1730

.

Ellepola
AN

Morrison
CJ

.

Laboratoryjna diagnostyka inwazyjnej kandydozy
J Microbiol
2005
43
56
84
Clinical and Laboratory Standards Institute
Principles and procedures for blood cultures, zatwierdzone wytyczne. Dokument CLSI M47-A
2007
Wayne, PA
Clinical and Laboratory Standards Institute

.

Leave a Reply