Epidemiologien af fungemia på et hospital for smitsomme sygdomme i Mexico City: En 10-årig retrospektiv gennemgang

Abstract

Epidemiologien af invasive svampeinfektioner har for nylig ændret sig i immunosupprimerede populationer som følge af HIV-infektion, organtransplantation, kemoterapi og hos ældre patienter. Diagnosen af invasive svampeinfektioner ved dyrkning er langvarig, da svampe vokser langsomt in vitro. vi ønskede at estimere frekvensen af fungemia-diagnoser etableret via det klinisk mykologiske laboratorium i løbet af de sidste 10 år; gennem et retrospektivt studie; data blev indhentet fra laboratoriets patientregister i Infektionshospitalets laboratorieregister af patienter med et systemisk svampeisolat mellem 2005 og 2014. Der blev identificeret et hundrede og toogtredive (132) systemiske svampeinfektioner. De var mere udbredt hos mænd, i aldersgruppen mellem 20 og 59 år og hos patienter med en AIDS-diagnose. De hyppigst isolerede agenser tilhørte slægten Candida og andre som Histoplasma sp., Cryptococcus sp., Aspergillus sp. , og Coccidioides sp. Af alle modtagne blod- og knoglemarvskulturer havde 17,9 % svampeudvikling; af disse var det i 70 % af tilfældene gennem blodkulturer. Generelt blev svampeagenser ikke mistænkt diagnostisk. Vi identificerede, at tres procent (60 %) af svampedannelserne udviklede sig hos AIDS-patienter, efterfulgt af patienter med sepsis. De mest almindelige agenser tilhørte slægten Candida, fortrinsvis albicans-arten. De blev hyppigere identificeret ved blodkultur end ved knoglemarvskultur. Invasive svampeinfektioner har ikke fulgt et sædvanligt klinisk mønster og er ikke let genkendelige.

Indledning

Epidemiologien af invasive infektioner har for nylig undergået ændringer med hensyn til forekomsten af svampeinfektioner i befolkningsgrupper, der er immunsupprimeret på grund af humant immundefektvirus (HIV), organtransplantation, kemoterapi og hos ældre patienter. I litteraturen beskrives et betydeligt antal systemiske svampeinfektioner, der skyldes filamentøse, gærlignende eller endemiske dimorfe mikroorganismer. 1

Der bør fremhæves to kategorier af svampeinfektioner: dem af opportunistisk oprindelse og dem af endemisk oprindelse. Endemiske infektioner betragtes som primære, og modtagelighed for infektion afhænger af geografisk eksponering for svampen i dens naturlige habitat. Dette er eksemplificeret ved værtens adgang gennem luftvejene til organismer som Histoplasma capsulatum, Coccidioides immitis og Blastomyces dermatitidis.2-5

De mere kendte agenser, der fører til opportunistiske mykoser, omfatter Candida albicans, Cryptococcus neoformans, Aspergillus fumigatus og Pneumocystis jirovecii, der normalt invaderer luftvejene, mave-tarmkanalen eller intravaskulære anordninger. 6 Med hensyn til hyppigheden af disse infektioner i visse immunsvækkede befolkningsgrupper er den anslåede årlige incidens af candidæmi blevet rapporteret som 72 til 290 infektioner pr. million, 30 til 66 infektioner pr. million i tilfælde af C. neoformans og 12 til 34 infektioner pr. million for Aspergillus sp.7

Over 17 forskellige arter af Candida er blevet identificeret som ætiologiske agenter for systemisk candidiasis. De mest almindelige arter er C. albicans, C. glabrata, C. parapsilosis og C. tropicalis.8 , 9 I de sidste to årtier er candidæmi steget hos hospitalsindlagte patienter og hos ambulante patienter med langvarige katetre til fastsiddende katetre. 10 , 11 Candidæmi er den hyppigste årsag til invasive svampeinfektioner hos hospitalsindlagte patienter og den fjerde hyppigste årsag til svampeinfektioner på intensivafdelinger. 12 , 13 Andre infektioner såsom cryptococcosis, histoplasmose og coccidiomycosis er også steget i hyppighed i immunsupprimerede populationer. Cryptococcosis er en hyppig opportunistisk infektion, ikke kun hos patienter med HIV, men også hos modtagere af solide organer og stamcelletransplantater. 14 , 15 Denne gradvise stigning i invasive svampeinfektioner har påvirket de berørte patienters morbilitet og dødelighed; 16 desuden er respons på behandling i forbindelse med iboende svampesvampresistens blevet et problem i forbindelse med håndteringen af disse infektioner, hvilket yderligere kompromitterer de tilknyttede dødelighedsprocenter. 17

På baggrund af dette perspektiv er det nødvendigt at anerkende de aktuelle tendenser og forekomst af patogene svampeagenser og dermed eventuelt orientere klinikeren med hensyn til diagnose og behandling. Generelt er vi afhængige af data baseret på mikrobiologiske fund og værtens kliniske karakteristika, der er opnået fra forskellige undersøgelser og institutioner. En undersøgelse rapporterede 983 tilfælde af påvist invasiv svampeinfektion og 875 sandsynlige tilfælde over en 5-årig periode, hvor invasiv aspergillose var den mest almindelige diagnose (43 % af tilfældene), efterfulgt af invasiv candidose i 28 % og zygomycose i 8 %17 , selv om disse resultater varierede alt efter den medicinske institution. I 2002 definerede den europæiske organisation for forskning og behandling af kræft og mykose (EORTC) de faktorer, der fastlægger klassifikationen af infektioner som påvist, sandsynlig eller mulig. 18 , 19

Vi anser det for vigtigt at kende hyppigheden af fungemia-diagnoser baseret på patientjournalen i Mykologisk Laboratorium Hospital, registreret i de sidste 10 år Infektionssygdomme.

Materiale og metoder

Dette er en retrospektiv, deskriptiv undersøgelse. Data blev indhentet fra patientregistret i laboratoriet på hospitalet for infektionssygdomme, i Mexico City, mellem januar 2005 og december 2014. Blodkulturer blev behandlet med automatiserede BACTEC ® 9240 (Becton Dickinson Diagnostic Systems, Sparks, MD, USA) og Bact/ALERT ® 3D-systemer (bioMérieux, Frankrig). Gæridentifikation blev udført med fænotypiske procedurer, herunder udsåning i chromogen agar og biokemisk testning med kommercielle Vitek ®-kort (bioMérieux, Frankrig). Filamentøse svampe blev identificeret på grundlag af deres makro- og mikromorfologiske karakteristika. 20

I forbindelse med undersøgelsen blev fungæmi defineret som vækst af svampe i blod, knoglemarv eller biopsi; dette var baseret på den definition af påviste systemiske mykoser, der er fastlagt ved international konsensus. 18

Statistisk analyse

Den samlede dataanalyse og normalitetstest blev udført med deskriptive metoder, der målte tendenser, simple frekvenser og procentfordeling af undersøgelsespersonernes generelle karakteristika.

Etiske overvejelser

Denne undersøgelse var baseret på data indhentet fra Mykologiafdelingens register, så ingen manipulation af variabler, der potentielt kunne kompromittere patientens autonomi eller påvirke princippet om beneficence- nonmaleficence for den enkelte blev bragt i fare. Alle bestemmelser i Sundhedsloven i undersøgelsen og Helsinki-erklæringen, der blev gennemgået på den 64. generalforsamling, der blev gennemført i Fortaleza, Brasilien, i oktober 2013, blev overholdt; erklæringen var primært rettet mod læger, der var involveret i forskning på mennesker, og fokuserede primært på datafortrolighed. Desuden blev vedtægterne i de generelle sundhedslove med hensyn til forskning i sundhed, artikel 17, også opfyldt: denne undersøgelse udgjorde ingen risiko for patienterne.

Resultater

Vi gennemførte en beskrivende undersøgelse baseret på fungemia-registreringer fra det medicinske mykologilaboratorium mellem januar 2005 og december 2014; der blev identificeret et hundrede og toogtredive (132) systemiske infektioner af svampeoprindelse. Generelt blev der modtaget fire blodkulturflasker fra hver patient, og vi inkluderede en enkelt positiv kultur i undersøgelsen, selv om der var mere end én på hinanden følgende blodkultur, der dyrkede den samme organisme. Infektioner var mere almindelige hos mænd (75,8 %), og den højeste hyppighed af tilfælde blev observeret i gruppen mellem 20 og 59 år (gennemsnit 39,4 år, standardafvigelse (SD) 13,2 år). I den pædiatriske gruppe under 16 år blev infektion påvist i en gennemsnitsalder på 52,8 måneder (SD 54,1 måneder); i 26 tilfælde var patientens alder ikke tilgængelig. Underliggende sygdom var hiv/aids i 63 % af tilfældene, efterfulgt af sepsis, diabetes mellitus og hæmatologiske sygdomme (tabel 1 ).