26.13: Miten entsyymit toimivat? Sitraattisyntaasi

Sitraattisyntaasin katalysoima oksaloasetaatti sitraatiksi

Sitraattisyntaasi on 433 aminohappoa sisältävä proteiini, jossa on erilaisia funktionaalisia ryhmiä, jotka voivat reagoida substraattien kanssa. Tämä entsyymi katalysoi oksaloasetaattia tuottaakseen lopulta sitraattia osana sitruunahappokiertoa (Krebs). Sitruunahappokierron (Krebsin kierron) ensimmäisessä vaiheessa asetyylikoA kondensoituu oksaloasetaatin kanssa muodostaen (S)-sitrylikoA:ta. Sitraattisyntaasin asparagiinihapon (B:) karboksylaattiryhmä poistaa asetyyli-CoA:n happaman alfaprotonin, kun taas histidiinikohta (H-A) luovuttaa protonin enolin muodostamiseksi. Sitten toinen histidiinipaikka (H-A) protonoi oksaloasetaatin karbonyylihapen, kun taas enoli hyökkää karbonyylihiileen. Samanaikaisesti tuo ensimmäinen histidiini (:A-) deprotonoi asetyylikoA-enolin. Syntyy (S)-sitryyli-CoA.

(S)-sitryyli-CoA:n tioesterin asyyliryhmä voidaan siirtää vesimolekyyliin hydrolyysireaktiossa, jolloin (S)-sitryyli-CoA muuttuu sitraatiksi. Sitraattisyntaasin histidiinipaikat ovat jälleen olennainen osa mekanismia ja avustavat protonien poistamisessa ja lisäämisessä.