26.13: Hvordan fungerer enzymer? Citrat Synthase

Oxaloacetat til Citrat katalyseret af Citrat Synthase

Citrat synthase er et protein med 433 aminosyrer med forskellige funktionelle grupper, der kan reagere med substrater. Dette enzym katalyserer oxaloacetat for i sidste ende at producere citrat som en del af citronsyrecyklussen (Krebs). I det første trin af citronsyrecyklussen (Krebs) kondenseres acetyl-CoA med oxaloacetat til (S)-citryl-CoA. Carboxylatgruppen på en asparaginsyre (B:) på citratsyntase fjerner den sure alfaproton på acetyl-CoA, mens et histidinsted (H-A) afgiver en proton til dannelse af enol. Derefter protonerer et andet histidinsted (H-A) oxaloacetatets carbonylsyre, mens carbonylens kulstof angribes af enolen. På samme måde deprotonerer det første histidin (:A-) acetyl-CoA-enolen. Der dannes (S)-citryl CoA.

Acylgruppen i en thioester af (S)-citryl CoA kan overføres til et vandmolekyle i en hydrolysereaktion for at omdanne (S)-citryl CoA til citrat. Igen er histidin-steder på citratsyntase en integreret del af mekanismen og hjælper med fjernelse og tilføjelse af protoner.