26.13: Hur fungerar enzymer? Citratsyntas

Oxaloacetat till citrat katalyseras av citratsyntas

Citratsyntas är ett protein med 433 aminosyror med olika funktionella grupper som kan reagera med substrat. Detta enzym katalyserar oxaloacetat för att slutligen producera citrat som en del av citronsyracykeln (Krebs). I det första steget i citronsyracykeln (Krebs) kondenserar acetyl-CoA med oxaloacetat för att bilda (S)-citryl-CoA. Karboxylatgruppen hos en asparaginsyra (B:) på citratsyntas avlägsnar den sura alfaprotonen på acetyl-CoA, medan en histidinplats (H-A) donerar en proton för att bilda enolen. Därefter protonerar en andra histidinplats (H-A) oxaloacetatets karbonylsyre, medan kolet i karbonylen angrips av enolen. På samma sätt deprotonerar det första histidinet (:A-) acetyl-CoA-enolen. (S)-citryl CoA bildas.

Acylgruppen i en thioester av (S)-citryl CoA kan överföras till en vattenmolekyl i en hydrolysreaktion för att omvandla (S)-citryl CoA till citrat. Återigen är histidinplatser på citratsyntas en integrerad del av mekanismen och hjälper till att avlägsna och lägga till protoner.