26.13: Cum funcționează enzimele? Sinteza citratului

Oxaloacetat în citrat catalizat de sinteza citratului

Sinteza citratului este o proteină cu 433 de aminoacizi cu diverse grupări funcționale care pot reacționa cu substraturile. Această enzimă catalizează oxaloacetatul pentru a produce în cele din urmă citrat ca parte a ciclului acidului citric (Krebs). În prima etapă a ciclului acidului citric (Krebs), acetil CoA se condensează cu oxaloacetatul pentru a forma (S)-citril CoA. Grupa carboxilat a unui acid aspartic (B:) de pe citrat-sintetază îndepărtează protonul alfa acid de pe acetil CoA, în timp ce un situs de histidină (H-A) donează un proton pentru a forma enolul. Apoi, un al doilea situs de histidină (H-A) protonează oxigenul carbonil al oxaloacetatului, în timp ce carbonul carbonilului este atacat de enol. În mod similar, acea primă histidină (:A-) deprotonează enolul acetil CoA. Se generează (S)-citril CoA.

Grupul acil al unui tioester de (S)-citril CoA poate fi transferat la o moleculă de apă într-o reacție de hidroliză pentru a transforma (S)-citril CoA în citrat. Din nou, situsurile de histidină de pe citrat-sintetază fac parte integrantă din mecanism și ajută la eliminarea și adăugarea de protoni.

.