26.13: Come funzionano gli enzimi? Citrato sintasi

Oxaloacetato a citrato catalizzato da citrato sintasi

Il citrato sintasi è una proteina con 433 aminoacidi con vari gruppi funzionali che possono reagire con substrati. Questo enzima catalizza l’ossalacetato per produrre infine citrato come parte del ciclo dell’acido citrico (Krebs). Nel primo passo del ciclo dell’acido citrico (Krebs), l’acetil CoA si condensa con l’ossalacetato per formare (S)-citryl CoA. Il gruppo carbossilato di un acido aspartico (B:) sulla citrato sintasi rimuove il protone alfa acido sull’acetil CoA, mentre un sito di istidina (H-A) dona un protone per formare l’enolo. Poi un secondo sito di istidina (H-A) protonerà l’ossigeno carbonilico dell’ossalacetato, mentre il carbonio del carbonile sarà attaccato dall’enolo. Simultaneamente, la prima istidina (:A-) deprotonerà l’enolo dell’acetil CoA. (S)-citryl CoA è generato.

Il gruppo acile di un tioestere di (S)-citryl CoA può essere trasferito a una molecola d’acqua in una reazione di idrolisi per convertire (S)-citryl CoA in citrato. Ancora una volta i siti di istidina sulla citrato sintasi sono parte integrante del meccanismo e aiutano la rimozione e l’aggiunta di protoni.