26.13: Jak fungují enzymy? Citrátová syntáza

Oxaloacetát na citrát katalyzuje citrátová syntáza

Citrátová syntáza je protein se 433 aminokyselinami s různými funkčními skupinami, které mohou reagovat se substráty. Tento enzym katalyzuje oxaloacetát za konečné produkce citrátu v rámci cyklu kyseliny citronové (Krebsova cyklu). V prvním kroku cyklu kyseliny citronové (Krebsova cyklu) dochází ke kondenzaci acetyl CoA s oxaloacetátem za vzniku (S)-citryl CoA. Karboxylátová skupina kyseliny asparagové (B:) na citrát synthase odstraňuje kyselý alfa proton na acetyl CoA, zatímco histidinové místo (H-A) daruje proton za vzniku enolu. Poté druhé histidinové místo (H-A) protonuje karbonylový kyslík oxaloacetátu, zatímco uhlík karbonylu je atakován enolem. Současně tento první histidin (:A-) deprotonuje enol acetyl CoA. Vzniká (S)-citryl CoA.

Acylová skupina thioesteru (S)-citryl CoA může být přenesena na molekulu vody v hydrolýzní reakci za přeměny (S)-citryl CoA na citrát. Nedílnou součástí mechanismu jsou opět histidinová místa na citrát-syntáze, která pomáhají při odstraňování a přidávání protonů

.