HemOnc: A new standard vocabulary for chemotherapy regimen representation in the OMOP common data model

Systematisk tillämpning av observationsdata för att förstå effekterna av cancerbehandlingar kräver detaljerade informationsmodeller som gör det möjligt att göra meningsfulla jämförelser mellan behandlingsregimer. Tyvärr är detaljer om systemiska behandlingar sällsynta i register och datalager, främst på grund av protokollens komplexa natur och bristande standardisering. Sedan 2011 har vi skapat en kurerad och halvstrukturerad webbplats för kemoterapiregimer, HemOnc.org. I samordning med OHDSI (Observational Health Data Sciences and Informatics) Oncology Subgroup har vi omvandlat en betydande delmängd av detta innehåll till den gemensamma OMOP-datamodellen, med bindningar till flera externa vokabulärer, t.ex. RxNorm och National Cancer Institute Thesaurus. För närvarande finns det >73 000 begrepp och >177 000 relationer i den fullständiga vokabulären. Innehåll som rör definitionen och sammansättningen av kemoterapiregimer har släppts i ATHENA-verktyget (athena.ohdsi.org) för att användas allmänt av OHDSI:s medlemmar. Här beskriver vi grunderna, datamodellen och det inledande innehållet i HemOnc-vokabulären tillsammans med flera användningsfall för vilka den kan vara värdefull.