Flock (biofilm)

En flock är en typ av mikrobiellt aggregat som kan jämföras med biofilmer och granulat eller betraktas som en specialiserad typ av biofilm. Flockar uppträder som grumliga suspensioner av celler som flyter i vatten, snarare än att de fästs vid och växer på en yta som de flesta biofilmer. Flocken hålls vanligtvis samman av en matris av extracellulär polymer substans (EPS), som kan innehålla varierande mängder polysackarid, protein och andra biopolymerer. Flockbildningen och flockarnas egenskaper kan påverka prestandan hos bioreaktorer för industriell vattenrening, t.ex. aktiverade slamsystem där flocken bildar ett slamtäcke.

Flockbildningen kan vara till fördel för de ingående mikroorganismerna på flera sätt, bl.a. genom att de skyddas från pH-stress, är motståndskraftiga mot predation, manipulerar mikromiljöer och underlättar ömsesidiga relationer i blandade mikrobiologiska samhällen.

I allmänhet är mekanismerna som gör att flockbildande mikrobiella aggregat håller ihop dåligt förstådda. Arbetet med den aktiverade slambakterien Zoogloea resiniphila har dock visat att PEP-CTERM-proteiner måste uttryckas för att flockar ska bildas; i deras frånvaro är tillväxten planktonisk, även om exopolysackarid produceras.

Två stammar av Zoogloea resiniphila. Röret till vänster visar typiska flockbildningar i en annars klar kultur av en bakterie, Zoogloea resiniphila, som isolerats från en reaktor för rening av avloppsvatten med aktiverat slam. I röret till höger resulterar planktonisk tillväxt av en mutant med flocknedsättning i ett grumligt utseende.