EcoCyc: Encyclopedia of E. coli genes and metabolism

EcoCyc är en elektronisk referenskälla för biologer som arbetar med E. coli och relaterade mikroorganismer. EcoCyc ingår i BioCyc Database Collection och är en bioinformatisk databas som beskriver genomet, det metaboliska nätverket och regleringsnätverket för Escherichia coli K-12 MG1655.

EcoCyc-data härstammar från litteraturbaserad kurering av hela genomet, det transkriptionella regleringsnätverket, transportörer och metaboliska vägar för E. coli. Det långsiktiga projektmålet är att underlätta en förståelse på systemnivå av E. coli genom att katalogisera cellens molekylära komponenter och deras funktioner.

EcoCyc-webbplatsen stöder jämförande analyser av flera E. coli-stammar och analys av data med hög genomströmning.

Det beskrivna projektet stöddes av Grant Number U24GM077678 från National Institute of General Medical Sciences. Innehållet är enbart författarnas ansvar och representerar inte nödvändigtvis de officiella åsikterna hos National Institute of General Medical Sciences eller National Institutes of Health.