The basics of 2D DIGE

Technika dwuwymiarowej (2D) elektroforezy żelowej jest potężnym narzędziem do rozdzielania złożonych mieszanin białek, ale od czasu jej powstania w połowie lat 70-tych, zyskała piętno bardzo trudnej aplikacji do opanowania i była generalnie używana do jej najlepszego efektu przez ekspertów. Wprowadzenie komercyjnie dostępnych immobilizowanych gradientów pH na początku lat 90. zapewniło lepszą odtwarzalność i łatwiejsze protokoły, co doprowadziło do wyraźnego wzrostu popularności tej techniki. Jednakże zmienność między żelami była nadal trudna do kontrolowania bez użycia replik technicznych. W połowie lat 90-tych (w tym samym czasie co narodziny „proteomiki”), koncepcja multipleksowania znakowanych fluorescencyjnie białek do separacji w żelu 2D została zrealizowana przez grupę Jona Mindena i doprowadziła do możliwości zaprojektowania eksperymentów w taki sposób, aby praktycznie wyeliminować zmienność żel-żel, co spowodowało, że repliki biologiczne są wykorzystywane do analizy statystycznej z możliwością wykrycia bardzo małych zmian we względnej obfitości białek. Technologia ta jest określana jako elektroforeza różnicowa w żelu 2D (2D DIGE).