Jak nazywają się enzymy

Ezym jest cząsteczką białka, która może działać jako katalizator biologiczny. Enzymy posiadają trzy charakterystyczne cechy. Po pierwsze, podstawową funkcją enzymu jest zwiększenie szybkości reakcji. Po drugie, jeden konkretny enzym działa specyficznie na jeden konkretny substrat, wytwarzając produkt. I po trzecie, aktywność enzymów może być regulowana od niskiej do wysokiej i odwrotnie. Niektóre enzymy są zdolne do katalizowania tej samej reakcji. Są one nazywane izozymami. Unikalny zestaw około 3,000 enzymów jest genetycznie zaprogramowany do syntezy, zapewniając indywidualność komórce. Jeśli jeden enzym ulegnie uszkodzeniu, efekt będzie katastrofalny. Nazwy zwyczajowe, jak również nazwy systematyczne, są używane w nazewnictwie enzymów.

Ten artykuł wyjaśnia,

1. Jak nazywane są enzymy
2. Zasady nazewnictwa enzymów
3. Poziomy klasyfikacji enzymów

Jak nazywają się enzymy

Powszechne nazwy enzymów zazwyczaj zawierają przedrostek opisujący nazwę substratu, na który działają enzymy, lub reakcję chemiczną, którą katalizują. Po przedrostku następuje przyrostek „ase”. Przyrostek ten oznacza po prostu identyfikację, że dany związek jest enzymem. Na przykład, enzym rozkładający białka na aminokwasy nosi nazwę „proteinazy” lub „proteazy”. Podobnie, enzym biorący udział w odwadnianiu alkoholi nosi nazwę „dehydrogenaza alkoholowa”. Jednak przy nazywaniu niektórych pierwotnie badanych enzymów, takich jak rennina, pepsyna i trypsyna, stosuje się starsze, banalne nazwy. Enzym glukozydaza jest przedstawiony na rysunku 1. Katalizuje on przekształcenie maltozy w dwie cząsteczki glukozy.

Figure 1: Glucosidase enzyme

Nomenklatura systematyczna i klasyfikacja enzymów według reakcji, którą katalizują, zostały opracowane przez Międzynarodową Unię Biochemii i Biologii Molekularnej (IUBMB). Zarówno nomenklatura, jak i klasyfikacja enzymów są traktowane łącznie ze względu na ich bliską współzależność.

Zasady nazewnictwa enzymów

Trzy ogólne zasady w nazewnictwie enzymów są następujące,

1. Przyrostek -aza powinien być używany tylko w odniesieniu do pojedynczych jednostek katalitycznych. Nie można go zatem stosować do układów zawierających więcej niż jeden enzym.
2. Klasyfikacja zasad i nomenklatura powinny być oparte na reakcji, którą dany enzym katalizuje.
3. Enzymy dzieli się na grupy, w zależności od katalizowanych reakcji.

Powiązane funkcjonalnie grupy enzymów klasyfikuje się, przypisując każdej grupie numery kodowe. Numery kodowe są poprzedzone literą „EC” wraz z czterema elementami oddzielonymi punktami. Cztery elementy mają następujące znaczenie:

1. Pierwsza cyfra oznacza klasę enzymu.
2. Druga cyfra oznacza podklasę enzymu.
3. Czwarta cyfra oznacza podklasę enzymu.
4. Piąta cyfra oznacza numer seryjny enzymu w jego podklasie.

Klasyfikacja enzymów

Najwyższy poziom klasyfikacji enzymów, ich nazwy i funkcje przedstawiono w poniższej tabeli.

Tabela 1: Najwyższy poziom klasyfikacji enzymów

Enzym może być w pełni określony przez tę nomenklaturę. Na przykład, heksokinaza jest transferazą (EC 2), dodającą grupę fosforanową (EC 2.7) do cukrów heksozowych zawierających grupę alkoholową (EC 2.7.1). Stąd, nomenklatura heksokinazy to EC 2.7.1.1.

Wniosek

Enzymy zwiększają szybkość reakcji poprzez ich katalizowanie. Są one powszechnie nazywane w oparciu o substrat, że działają na. Enzymy są również nazywane w oparciu o typ reakcji, którą katalizują. Systematyczna nomenklatura, łącząca się z klasyfikacją enzymów, została opracowana przez IUBMB. Enzymy są rozwinięte w sześć klas przez systematyczną nomenklaturę enzymatyczną.

Referencja:
1. „Enzyme Nomenclature.” IUBMB Biochemical Nomenclature. N.p., b.d. Web. 20 maja 2017. <http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/>.
2. „Classification and Nomenclature of Enzymes by the Reactions they Catalyse.” Enzyme Classification. N.p., b.d. Web. 20 maja 2017. <http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/rules.html>.
3. „Rola enzymów w reakcjach biochemicznych.” Enzymes. N.p., b.d. Web. 20 maja 2017. <http://chemistry.elmhurst.edu/vchembook/570enzymes.html>.
4. „Introduction to Enzymes.” Nazewnictwo i Klasyfikacja (Introduction to Enzymes). N.p., b.d. Web. 20 maja 2017. <http://www.worthington-biochem.com/introbiochem/naming.html>.

Image Courtesy:
1. „Glucosidase enzyme” By Thomas Shafee – Own work (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia

.