HemOnc: A new standard vocabulary for chemotherapy regimen representation in the OMOP common data model

Systematyczne zastosowanie danych obserwacyjnych do zrozumienia wpływu leczenia nowotworów wymaga szczegółowych modeli informacyjnych pozwalających na sensowne porównania pomiędzy schematami leczenia. Niestety, szczegóły dotyczące terapii systemowych są rzadkością w rejestrach i hurtowniach danych, głównie ze względu na złożoną naturę protokołów i brak standaryzacji. Od 2011 roku tworzymy portal HemOnc.org, który zawiera kuratorskie i półstrukturalne informacje o schematach chemioterapii. We współpracy z podgrupą OHDSI (Observational Health Data Sciences and Informatics) przekształciliśmy znaczny podzbiór tej zawartości do wspólnego modelu danych OMOP, z powiązaniami z wieloma zewnętrznymi słownikami, np. RxNorm i National Cancer Institute Thesaurus. Obecnie w pełnym słowniku znajduje się >73 000 pojęć i >177 000 relacji. Zawartość związana z definicją i składem schematów chemioterapii została udostępniona w ramach narzędzia ATHENA (athena.ohdsi.org) do szerokiego wykorzystania przez członków OHDSI. Tutaj opisujemy przesłanki, model danych i wstępną zawartość słownika HemOnc wraz z kilkoma przypadkami użycia, dla których może on być wartościowy.

.