HemOnc: A new standard vocabulary for chemotherapy regimen representation in the OMOP common data model
Systematische toepassing van observationele gegevens voor het begrijpen van de effecten van kankerbehandelingen vereist gedetailleerde informatiemodellen die zinvolle vergelijkingen tussen behandelingsregimes mogelijk maken. Helaas zijn details van systemische therapieën schaars in registers en datawarehouses, voornamelijk door de complexe aard van de protocollen en een gebrek aan standaardisatie. Sinds 2011 hebben we een gecureerde en semigestructureerde website van chemotherapieregimes opgezet, HemOnc.org. In coördinatie met de Observational Health Data Sciences and Informatics (OHDSI) Oncology Subgroup, hebben we een aanzienlijke subset van deze inhoud omgezet in het OMOP gemeenschappelijk datamodel, met bindingen naar meerdere externe vocabulaires, bv. RxNorm en de National Cancer Institute Thesaurus. Momenteel zijn er >73.000 concepten en >177.000 relaties in het volledige vocabulaire. Inhoud met betrekking tot de definitie en samenstelling van chemotherapieregimes is vrijgegeven binnen de ATHENA tool (athena.ohdsi.org) voor wijdverbreid gebruik door de OHDSI leden. Hier beschrijven we de grondgedachte, het gegevensmodel en de initiële inhoud van het HemOnc-vocabulaire, samen met verschillende gebruikssituaties waarvoor het waardevol kan zijn.
Leave a Reply