EcoCyc: Encyclopedia of E. coli genes and metabolism

EcoCyc is een elektronische referentiebron voor biologen die werken met E. coli en verwante micro-organismen. EcoCyc, dat deel uitmaakt van de BioCyc Database Collection, is een bioinformatica-database die het genoom, het metabolische netwerk en het regulatorische netwerk van Escherichia coli K-12 MG1655 beschrijft.

EcoCyc-gegevens zijn afgeleid van op literatuur gebaseerde curatie van het volledige genoom, het transcriptionele regulatorische netwerk, de transporters en de metabole routes van E. coli. Het lange-termijn doel van het project is om een systeem-niveau begrip van E. coli te vergemakkelijken door het catalogiseren van de moleculaire componenten van de cel en hun functies.

De EcoCyc website ondersteunt vergelijkende analyses van meerdere E. coli stammen en analyse van high-throughput data.

Het beschreven project werd ondersteund door Grant Number U24GM077678 van het Nationaal Instituut voor Algemene Medische Wetenschappen. De inhoud is uitsluitend de verantwoordelijkheid van de auteurs en vertegenwoordigt niet noodzakelijkerwijs de officiële standpunten van het National Institute of General Medical Sciences of de National Institutes of Health.

Leave a Reply