The basics of 2D DIGE

2次元ゲル電気泳動法は、複雑な混合タンパク質を分離する強力なツールだが、1970年代半ばの登場以来、習得が非常に難しいアプリケーションというスティグマを得て、一般には専門家がその効果を最大限に利用するものであった。 1990年代初頭に市販の固定化pH勾配剤が登場すると、再現性の向上とプロトコルの簡便化により、この技術は顕著に普及するようになった。 しかし、ゲル間のばらつきは、テクニカルレプリケートを使用しない限り、まだ制御が困難であった。 1990年代半ば（プロテオミクスの誕生と同時期）、Jon Mindenのグループにより、蛍光標識タンパク質を多重化して2次元ゲル分離するというコンセプトが実現し、ゲル間変動をほぼ排除する実験デザインが可能になった。その結果、相対的タンパク質量の非常に小さな変化を検出できる統計解析に生体試料を使用することが可能になった。 この技術は、2次元差分ゲル電気泳動（2D DIGE）と呼ばれている。