DNA Land áttekintés – A világ legnagyobb családfája?

Szerkesztette: Christina Swords, Ph.D.

7 tény a DNA Land áttekintésünkből

1. Helyszín: Ingyenes
2. Adatvédelem: az összegyűjtött genetikai adatokat tudományos kutatási projektekhez kívánja felhasználni
3. Alternatívák: Az összegyűjtött genetikai adatokat tudományos kutatási projektekhez kívánja felhasználni:

DNA Land Bevezetés

Ez egy áttekintés a DNA Landről, egy olyan cégről, amely genomadatokat gyűjt a felhasználóktól, hogy tudományos adatbázisokat építsen fel a kutatáshoz. A céget 2015-ben alapította a New York-i Genom Központ és a Columbia Egyetem kutatóinak egy csoportja. A cég 2019-ben tudományos intézményi honlapként bezárta működését, és nyereségorientált cégként újraindult.

A csapat még mindig az alapító tagokból áll: Dr. Yaniv Erlich, Dina Zielinski és Assaf Gordon. A szigorú humán alanyokra vonatkozó előírások miatt 2019. szeptember 30-ig törölték az összes összegyűjtött adathalmazt.

A DNA Land 2017-ben társult a National Breast Cancer Coalition (NBCC) szervezethez, hogy jobban megértse a mellrák genetikai kockázatát. Emellett Elrich a DNA Land és a Geni.com weboldal adatainak felhasználásával dolgozik a világ legnagyobb családfájának összeállításán.

Kíváncsi a legújabb genetikai felfedezésekre és arra, hogy azok hogyan vonatkoznak az Ön DNS-ére? A Nebula Genomics teljes genom szekvenálást kínál, amely az Ön DNS-ének 100%-át dekódolja. Ez lehetővé teszi számunkra, hogy hetente frissített jelentéseket nyújtsunk Önnek, amelyek képessé teszik arra, hogy a tudomány élvonalában maradjon! Kattintson ide, ha többet szeretne megtudni!

A DNS Land szolgáltatás

Mi az a DNS Land? Az önkénteseknek létre kell hozniuk egy DNS Land bejelentkezési fiókot, és alá kell írniuk egy 1500 szavas beleegyező nyilatkozatot. Ebben egyszerűen, jogi zsargon nélkül ismertetik a genetikai adatok megosztásának kockázatait és előnyeit.

A weboldal olyan adatokat gyűjt, mint az e-mail címek, genomikai adatok, alapvető demográfiai információk a résztvevőkről és a közvetlen családtagokról, valamint vonások. A fenotípusokat is tárolják a fizikai és egészségügyi jellemzőkkel foglalkozó kérdőívek biztosításával. Minden kérdőív egyetlen tulajdonságra vonatkozik, és a felhasználók kiválaszthatják, hogy mely kérdőíveket töltik ki.

A vállalat ingyenes szolgáltatásokat nyújt ösztönzőként a DNS Landet használó felhasználóknak, feltöltve a nyers adatokat. Ezek közé tartozik (i) az ősök összetételéről szóló jelentés, (ii) a rokonkereső és (iii) az érdekes fizikai és wellness tulajdonságok előrejelzése. Emellett genetikai információkat is imputál, ami lehetővé teszi a felhasználók számára, hogy olyan genetikai variációkat találjanak, amelyek nem voltak részei az eredeti fájlnak.

A vállalat azt is ígéri, hogy a jövőben további egyedi funkciókkal bővíti weboldalát.

A DNA Land Reporting áttekintése

Az adatok feltöltésével kezd a weboldalra. Az oldal a nyers DNS-fájl feltöltése esetén jelentéseket készít az ősökről, a rokonokról, a tulajdonságokról és a büntetlenségről.

Review of DNA Land Ancestry Report

A felmenők megtalálásához egy több mint 6000 egyedből álló, 40 populációba (köztük az amerikai őslakosokéba) szervezett referenciapanelt használnak. Az “Ancestry” programot arra használják, hogy hasonlóságokat keressenek a felhasználó DNS-összetétele és a referenciapopulációk egyedei között.

Az ancestry jelentés megadja, hogy honnan származnak a gének (1a. ábra). Megbecsüli az etnikai hovatartozást, és térképet ad a legközelebbi DNS-egyezések helyéről. Az őstörténeti táblázatok mellett egy térképet is kínál, amely az egyező referenciapopulációkat mutatja az egész világon (1b,c ábra).

A jelentésben szereplő vagy abból kizárt minden egyes népesség tényleges bontása is szerepel. Ezek további információkat is tartalmaznak e csoportok genetikai összetételéről (1d. ábra).

A DNS Land Relative Finder Report

A felhasználók a genomikai adatok feltöltése után is megtalálhatják legközelebbi rokonaikat. A szolgáltatás kiszámítja a különböző rokonokkal közös DNS hasonlóságát. Ezek a számítások a közös DNS-szegmensek számát és a közös DNS teljes hosszát használják az egyezések meghatározásához. A jelentés a közös szegmensek vizualizációját is tartalmazza.

A DNS Land tulajdonságok előrejelző jelentése

A DNS Land jelentést készít az egynukleotid-polimorfizmusoknak (SNP) nevezett genetikai változatok és a biológiai tulajdonságok közötti összefüggésekről. A megjósolt tulajdonságokat wellness (kronotípus, kávéfogyasztás, iskolázottság) és fizikai (szemszín, magasság és rövidlátás) kategóriákba sorolják.

Minden jelentés egy tulajdonságot jósol meg a felhasználó genomikai információi alapján. Emellett összehasonlítja a valószínűségi pontszámot az adatbázisban rendelkezésre álló információkkal.

A felhasználók először egy felmérést végeznek, mielőtt megkapják a DNS-előrejelzés eredményeit. Ez lehetővé teszi a felhasználók számára, hogy teszteljék a weboldal által készített előrejelzések pontosságát.

Egy példa a felmérésre:

A DNS Land által a genomikai adatok alapján készített jelentés három összetevőből áll.

A jelentés első szegmense azt mutatja, hogy az ismert genetikai variánsok alapján mennyire valószínű egy bizonyos állapot a felhasználók esetében. Ilyen lehet például, hogy az ismert genetikai variánsok felhasználásával azt sugallja, hogy Ön valószínűleg reggeli ember. A grafikon azt is mutatja, hogy ez az előrejelzés hogyan viszonyul más felhasználókhoz.

A következőben a vállalat részletezi, hogy milyen genetikai variánsok vagy SNP-k (Single Nucleotide Polymorphisms) járulnak hozzá a tulajdonság előrejelzett pontszámához. Azt is tartalmazza, hogy ez a hozzájárulás mekkora. A felhasználók a hatásméretek grafikonjának felfedezésével azt is megjeleníthetik, hogy ezek az SNP-k hol helyezkednek el a kromoszómákon.

Végül a jelentés táblázatba foglalja az elemzésben szereplő legjelentősebb SNP-ket. Ez az információ részletes bontást tartalmaz a támogató kutatásokból. Ez tartalmazza az egyes SNP-k hatását és azokat a géneket, ahol a variánsok találhatók.

Ezek érdekes információk állnak rendelkezésre a genomadatokból az emberek tulajdonságaihoz való genetikai hozzájárulás tanulmányozásához. Az egyes SNP-k elhelyezkedése jelezheti az adott tulajdonsághoz való genetikai hozzájárulást.

DNS Land Árak

A vállalat által kínált összes szolgáltatás ingyenes. A felhasználók néhány órán vagy napon belül hozzáférhetnek a jelentéseikhez, miután feltöltötték genomikai adataikat. További jelentésekhez rövid kérdőívek kitöltésével lehet hozzájutni, amelyek segítik a kutatókat tanulmányaikban.

Review of DNA Land Privacy

A hozzájárulási feltételek biztosítják a felhasználók számára a teljes körű adatvédelmet a személyes adatok, az egyéni felmérési eredmények vagy bármely feltöltött felhasználói adat tekintetében. A felhasználók összekapcsolhatják közösségi média profiljaikat a weboldallal, de az adatokat a vállalat nem osztja meg.

A vállalat személyes adatokat oszthat meg olyan kiválasztott partnerekkel, akik jó biztonsági gyakorlatot tartanak fenn, tiszteletben tartják a hozzájárulást és betartják a szabályozást. A felhasználók lemondhatnak erről a lehetőségről, bár a személyes adatok kiadhatók, ha a törvény előírja.

A Geni.com fiókjukat (egy családfaépítésre szolgáló weboldal) összekapcsoló felhasználók információkat találhatnak más, összekapcsolt fiókkal rendelkező felhasználókról.

A vállalat törölte az akadémiai változatban tárolt adatokat, amikor azok 2019-ben kereskedelmi forgalomba kerültek.

DNA Land a hírekben

A vállalat bőséges médiafigyelmet élvezett, főként a Columbia Egyetemtől és a New York-i Genom Központból való kiválás előtt. A felhasználói adatokat felhasználó genetikai eredményeiket olyan elismert folyóiratokban is publikálták, mint a Nature Genetics és az eLife.

• The Crowdsourcing Site That Wants to Pool Our Genomes
• Crowdsourced genomic resource DNA Land relaunch company
• Scientists hope to attract millions to DNA Land

Yaniv Erlich 2018-ban Ted-előadást tartott a világ legnagyobb családfájának felépítéséről a DNA Land és a Geni adatainak felhasználásával.com.

A közelmúltban a DNA Land partnerségre lépett a Luna DNA-val, egy olyan céggel, amely lehetővé teszi, hogy hozzájáruljon a kutatáshoz és kompenzációt kapjon. Nézze meg a Luna DNA értékelését!

DNA Land vélemények

Mennyire pontos a DNA Land? Több DNS Land Reddit szálak alapján a felhasználók a 23andMe-t megbízhatóbbnak találták a pontosság szempontjából. Azonban vannak általános pozitív visszajelzések, köszönhetően annak, hogy ez egy ingyenes szolgáltatás, és olyan egyedi genetikai jellemzőket biztosít, amelyek különösen a genetikai genealógusok számára érdekesek. Néhány vélemény :

“Jobb felhasználói adatvédelem, mint a GEDMatch. Felhasználóbarátabb. Az ősi vs. friss DNS-elemzésük hasznos annak meghatározásában, hogy egy személy közelmúltbeli vagy távoli egyezésről van-e szó. Dr. Yaniv Erlich reagál a visszajelzésekre, és nagyon aktívan részt vesz a genetikai genealógiai közösségben. Bárcsak több felhasználója lenne.”

“Ingyenes, de a DNS-illesztés nem túl jó, és az adatbázis kicsi. Olyan egyezéseket találnak nekem ezen az oldalon, amelyek más oldalakon is megtalálhatóak, de olyan cm-számokkal, amelyek őrülten magasak.”

A weboldal új, kereskedelmi verziójáról még nem sok vélemény született.”

Előnyök és hátrányok

Előnyök

• A DNA Land legnagyobb előnye, hogy szolgáltatásai ingyenesek.
• A jelentések folyamatos fejlesztése részletesebb és vizuálisan vonzóbb ősökről szóló jelentéseket eredményez.
• Egyedi funkciók, mint az imputáció (statisztikai következtetés alkalmazása ismeretlen genotípusok levezetésére az ismert genotípusok alapján) és a közös genetikai szegmensek.
• A felhasználók úgy tűnik, több rokont találtak, mint más tesztelő cégek is.
• A felhasználók úgy érzik, hogy genomikai információik megadásával jobban kapcsolódnak a folyamatban lévő genetikai kutatáshoz.

Hátrányok

• Kicsi genomikai adatbázis.
• A származás és a tulajdonságok eredményei más tesztelő cégekkel összehasonlítva nem bizonyultak olyan pontosnak.
• A kezdeti felhasználók közül sokan kevés vagy egyáltalán nem találtak megfelelő rokont, mint más tesztelő cégek.

Összehasonlítások

A DNA Land áttekintését a Nebula Genomics és más genetikai tesztelő cégekkel való összehasonlítással fejezzük be.

	DNA Land	23andMe	Ancestry DNA	Nebula Genomics
DNS vizsgálat	Más cégektől kapott nyers adatfájlokat használ.	Szekvenálás helyett genotipizálást használ.	Szekvenálás helyett genotipizálást használ.	30x teljes genom szekvenálást kínál. Továbbá ingyenes nyers DNS-adatok feltöltését kínálja
Adatfeltöltési lehetőségek	Ingyenes DNS-jelentés a feltöltött adatokból.	Nincs adatfeltöltési lehetőség.	Nincs adatfeltöltési lehetőség.	Ingyenes kibővített DNS jelentés a feltöltött felhasználói adatokból
Heti frissített jelentés	Nem	Nem	Nem	Nem	Igen (további információk)
Mély ősi (Y-CHR és mtDNS szekvenálás)	Nem	Nem	Nem	Nem	Mély ősi jelentés teljes Y kromoszóma és mtDNS szekvenálással az FTDNA-val együttműködésben
Imputáció	Beleértve az imputációt a felhasználó által feltöltött adatokból feldolgozott jelentésbe.	Nem. Más forrásokat kell használni az imputáláshoz.	Nem. Más erőforrásokat kell használni az imputáláshoz.	Igen. Az imputációs eredményeket kibővített jelentésekben szolgáltatja

Az Ön által kedvelt egyéb DNS feltöltő oldalak:

• DNA Painter (genealógiához – az első ingyenes, a többihez előfizetés is elérhető)
• GedMatch Genesis (ingyenes DNS feltöltés és fizetős speciális opciók)
• Genetic Genie (ingyenes az egészségügyi jelentésekhez)
• LifeDNA (99 dollárért feltöltés és egészségügyi jelentések, DNS-készlet és frissítések felár ellenében)
• Living DNA (ingyenes feltöltés őstörténethez)
• MyHeritage (ingyenes feltöltés genealógiához)
• MyTrueAncestry (tanulja meg kapcsolatát az ősi populációkkal – ingyenes feltöltés – 397 $)
• WeGene (az ázsiai populációkra összpontosít, a jelentések ára)

Ha rendelkezik teljes genomszekvenálási adatokkal, nézze meg az YFull-t is ($25 – $49 Y-DNS és mtDNS esetén).

Ha az ősök vagy a genetikai genealógia érdekli, érdemes megnéznie a következőket is:

• 23andMe (99 dollár az alap őstesztért)
• African Ancestry (299 dollár vonalanként)
• AncestryDNA (99 dollár az őstesztért)
• CRI Genetics (99 dollár az őstesztért)
• DNA Painter (1. sz. profil ingyenes, a többihez előfizetés is elérhető)
• GedMatch Genesis (ingyenes DNS feltöltés genetikai genealógiához és fizetős haladó opciók)
• Living DNA (49$-tól)
• MyHeritage (99$ az őstesztért, további előfizetések a genealógiai eszközökhöz való hozzáférésért)
• WeGene (ázsiai felmenőkhöz)

Sem nézze meg a GEDmatch bemutatót, hogy megtanulja, hogyan használja ezt a hatékony eszközt!

Ha otthon végezhető apasági tesztet keres, olvassa el a HomeDNA értékelését is.

Ha az anyai és/vagy apai vonalra szeretne összpontosítani, megnézheti az YFull vagy YSeq szolgáltatásokat, amelyek az mtDNS-t vagy az Y-kromoszómát elemzik az egyes vonalbeli haplotípusok meghatározásához. A Full Genomes Y-kromoszóma szekvenálást és elemzést is kínál. Érdemes lehet etnikai specifikus teszteket is megnézni, például afrikai DNS-teszteket.

Megtetszett a DNA Land értékelésünk? További értékeléseket olvashat blogunkon, és megnézheti a legjobb DNS-tesztkészletről és más otthoni tesztekről szóló teljes útmutatónkat.