D-aminosavak a fehérjében: Az élet tükre, mint az öregedés molekuláris indexe

A fehérjék kizárólag l-aminosavakból állnak. Az idősek körében azonban d-aszparaginsav (d-Asp) maradványokat találtak a szemlencsében és az agyban, valamint más szövetekben is. A d-Asp jelenléte megváltoztathatja a fehérje magasabb rendű szerkezetét, ami viszont szerepet játszhat az olyan, korral összefüggő rendellenességekben, mint a szürkehályog és az Alzheimer-kór. A d-Asp az Asp-maradékok spontán racemizációjából ered az arra fogékony fehérjékben. Az öregedés során a fehérjékben lévő természetes lα-Asp-maradékok egy szukcinimidil köztiterméken keresztül nem enzimatikus úton l-β-, d-α- és d-β-izomerré izomerizálódnak. Ez az izomerizáció nem egyenletesen történik, hanem olyan specifikus maradékokon, amelyek szekvenciájuk vagy szerkezeti kontextusuk miatt érzékenyek az izomerizációra. Ezért meg kell állapítani az egyes Asp-maradékok jellegét a fogékony fehérjékben. A közelmúltban egy új, LC-MS/MS alapú módszert írtak le az Asp izomerizáció elemzésére specifikus fehérje helyeken. Ebben az áttekintésben először azt mutatjuk be, hogy a fehérjékben lévő aminosavak homokiralitása nem garantált az élet során. Ezután ismertetjük egy új módszer kifejlesztését a fehérjékhez kötött d-aminosavak analízisére, és tárgyaljuk a d-Asp negatív hatását a fehérjék szerkezetére és funkciójára.