Eikenella

Microbiologie et épidémiologie

Les espèces Eikenella, Pasteurella et Chromobacterium présentent des caractéristiques à la fois communes et contrastées en matière de propriétés de laboratoire, d’épidémiologie et de présentations cliniques. Le genre Eikenella ne contient qu’une seule espèce, Eikenella corrodens, qui appartient à la famille Neisseriaceae avec les genres Neisseria et Kingella.1-4 Le genre Pasteurella contient un certain nombre d’espèces d’importance clinique et appartient à la famille Pasteurellaceae avec les genres Aggregatibacter, Actinobacillus et Haemophilus. Le genre Chromobacterium ne contient qu’une seule espèce d’importance pour l’homme, C. violaceum, et est également placé actuellement dans la famille Neisseriaceae ; un certain nombre d’autres Chromobacterium spp. récupérées à partir de sources environnementales ont été proposées. La plupart de ces organismes sont des bacilles gram-négatifs microaérophiles, anaérobies facultatifs, quelque peu fastidieux, qui peuvent apparaître pléomorphes ou coccobacillaires dans les frottis directs ou les frottis préparés à partir de cultures. Eikenella et Pasteurella spp. sont non mobiles, tandis que C. violaceum est mobile et moins fastidieux que les autres.

Eikenella corrodens est un petit bâtonnet droit qui peut apparaître coccobacillaire. L’organisme est oxydase-positif et ornithine décarboxylase-positif, il réduit les nitrates en nitrites, mais ne produit pas de catalase, uréase, ou indole1.-On pensait à l’origine que E. corrodens était liée à la bactérie strictement anaérobie Bacteroides urealyticus (anciennement Bacteroides corrodens) en raison de la « corrosion » ou de la « piqûre » caractéristique de la surface de la gélose au sang ou au chocolat par certains isolats, ce qui suggère une préférence pour la croissance anaérobie.

La plupart des Pasteurella spp. sont oxydase- et catalase-positives, réduisent les nitrates et utilisent le glucose et une variété d’autres glucides. Les espèces les plus importantes pour l’homme sont P. multocida subsp. multocida, P. multocida subsp. septica, P. canis, P. dagmatis et P. stomatis.1,2,5-7 Un certain nombre d’autres Pasteurella spp. sont rarement, voire pas du tout, associées aux maladies humaines.1,2,5-La classification des Pasteurella spp. est en cours de révision sur la base d’études d’hybridation ADN-ADN et d’analyses de séquences d’ARN ribosomique et plusieurs espèces, dont P. pneumotropica, P. aerogenes et P. bettyae, pourraient être reclassées comme membres du genre Actinobacillus ou d’autres genres de la famille des Pasteurallaceae7.-9 Les organismes anciennement classés comme P. gallinarum sont maintenant Avibacterium gallinarum et certains anciennement classés comme P. haemolytica sont maintenant Mannheimia haemolytica.

Chromobacterium violaceum est un long bacille gram-négatif, légèrement incurvé. C. violaceum est positif pour la catalase, la nitrate réductase et l’arginine dihydrolase ; il se développe sur le sang de mouton, la gélose MacConkey, la gélose au chocolat et la gélose Mueller-Hinton ; il produit un pigment violet profond (violacéine) qui peut donner lieu à des colonies d’apparence noire. Ce pigment peut également être produit pendant l’infection, ce qui entraîne une cellulite violacée.

Eikenella corrodens fait partie de la flore normale de la cavité buccale, des voies respiratoires supérieures et des surfaces muqueuses des voies gastro-intestinales et génito-urinaires de l’homme et de certains mammifères.10,11 D’un point de vue diagnostic clinique et de laboratoire, il est utile de discuter d’E. corrodens dans le contexte des organismes du groupe dit « AACEK » (anciennement « HACEK »). Ce moyen mnémotechnique signifie Aggregatibacter aphrophilus (anciennement Haemophilus aphrophilus et H. paraphrophilus), Aggregatibacter (anciennement Actinobacillus) actinomycetemcomitans, Cardiobacterium hominis, E. corrodens, et Kingella kingae et autres Kingella spp. En tant que groupe, ce sont des organismes à croissance lente de la flore normale des voies respiratoires supérieures, qui nécessitent souvent des concentrations élevées de dioxyde de carbone et de l’hémine dans le milieu de culture pour une croissance optimale10. Les organismes AACEK sont cliniquement importants dans des syndromes pathologiques spécifiques, y compris les maladies disséminées, telles que l’endocardite bactérienne subaiguë et l’arthrite pyogénique, et les maladies pyogéniques localisées de la cavité buccale, de la tête et du cou.11 Comparé aux autres organismes du groupe AACEK, E. corrodens est moins fastidieux et est généralement récupérable en 24 à 48 heures sur les milieux habituels de gélose au sang et au chocolat. En raison de l’amélioration de la composition des bouillons de culture et des techniques de détection, les hémocultures des patients chez qui l’on soupçonne une endocardite due à E. corrodens ou à d’autres organismes du groupe AACEK ne doivent généralement pas être incubées au-delà des 5 jours habituels utilisés dans la plupart des laboratoires.1-3,12

On dispose de peu de données sur les facteurs de virulence potentiels produits par E. corrodens qui pourraient contribuer à l’invasion ou aux processus pathogènes. Une protéine de type lectine et de multiples protéines pilus sont présentes à la surface des cellules bactériennes et peuvent contribuer à l’adhérence aux cellules épithéliales des muqueuses. Certains gènes codant pour les protéines pilus partagent une homologie nucléotidique, et les protéines pilus présentent une homologie de séquence d’acides aminés, avec les gènes et les protéines pilines de Moraxella spp. et Neisseria gonorrhoeae. D’autres protéines de surface cellulaire ont la capacité d’agglutiner les globules rouges. Comme d’autres bactéries gram-négatives, la membrane cellulaire externe d’E. corrodens contient des protéines uniques, la paroi cellulaire possède des lipopolysaccharides et l’organisme peut synthétiser un polysaccharide extracellulaire ou une couche visqueuse. Il est difficile de déterminer la contribution spécifique de chacun de ces facteurs à la virulence, mais ils peuvent jouer un rôle dans l’inhibition de la phagocytose ou la modulation de l’activité des macrophages.2

Pasteurella spp. sont des commensaux des voies respiratoires supérieures de nombreuses espèces animales. Le portage oropharyngé de P. multocida se produit chez la plupart des chiens et des chats, y compris les grands félins (lions, tigres, panthères), ainsi que chez les porcs, les rats, les opossums, les lapins, les volailles et peut-être les humains.13 Les Pasteurella spp. sont des agents pathogènes primaires d’une variété d’animaux et plusieurs espèces peuvent causer une variété d’infections humaines, le plus souvent associées à des morsures ou des griffures d’animaux. Dans une étude portant sur 159 isolats humains de Pasteurella spp. récupérés à la suite de morsures de chien ou de chat, P. multocida subsp. multocida représentait 60 % des isolats, P. canis 18 %, P. multocida subsp. septica 13 %, P. stomatis pour 5 % et P. dogmatis pour 3 %.6 Pasteurella peut également être contractée par inhalation d’aérosols, et il peut y avoir des différences dans la propension des deux sous-espèces de P. multocida à causer des maladies des voies respiratoires14. Bien qu’une source animale soit présente dans la plupart des infections humaines à P. multocida, il n’y a pas d’exposition animale connue dans 5 à 15 % des cas. Les Pasteurella spp. peuvent généralement être isolées de la culture sur une gélose au sang ou au chocolat dans les 24 à 48 heures d’incubation ; la plupart des souches ne se développent pas sur la gélose MacConkey. Les frottis à la coloration de Gram de la croissance sur gélose révèlent de petits coccobacilles gram-négatifs. L’identification biochimique de P. multocida est simple, en particulier lorsqu’une histoire clinique est fournie ; cependant, l’identification de certaines autres espèces de Pasteurella peut être plus difficile.7-9

Les études des facteurs de virulence de Pasteurella spp. se sont concentrées sur P. multocida. La virulence de P. multocida peut être associée à la production de neuraminidase et d’endotoxine lipopolysaccharidique. Une toxine dermonécrotique, un facteur de virulence connu chez les animaux, peut être détectée plus fréquemment dans les souches isolées d’adultes atteints de bronchite chronique que dans d’autres sources. En outre, certaines souches ont été signalées comme produisant une cytotoxine.15

Chromobacterium violaceum est un saprophyte commun du sol et de l’eau, en particulier dans les zones tropicales et subtropicales.16,17 L’organisme pénètre généralement par la peau pour provoquer une infection localisée des plaies, mais une infection du sang et une infection disséminée peuvent survenir chez les patients présentant un dysfonctionnement immunitaire sélectif. C. violaceum peut être isolé facilement à partir de sang, de liquide d’abcès ou de drainage purulent. Les facteurs favorisant la virulence n’ont pas été identifiés.