EcoCyc : Encyclopédie des gènes et du métabolisme de E. coli

EcoCyc est une source de référence électronique pour les biologistes qui travaillent avec E. coli et les micro-organismes apparentés. Membre de la collection de bases de données BioCyc, EcoCyc est une base de données bioinformatique qui décrit le génome, le réseau métabolique et le réseau de régulation d’Escherichia coli K-12 MG1655.

Les données d’EcoCyc proviennent d’une curation basée sur la littérature de l’ensemble du génome, du réseau de régulation transcriptionnelle, des transporteurs et des voies métaboliques d’E. coli. L’objectif à long terme du projet est de faciliter une compréhension au niveau du système d’E. coli en cataloguant les composants moléculaires de la cellule et leurs fonctions.

Le site Web EcoCyc prend en charge les analyses comparatives de plusieurs souches d’E. coli et l’analyse des données à haut débit.

Le projet décrit a été soutenu par la subvention numéro U24GM077678 de l’Institut national des sciences médicales générales. Le contenu relève de la seule responsabilité des auteurs et ne représente pas nécessairement les points de vue officiels de l’Institut national des sciences médicales générales ou des Instituts nationaux de la santé.

Les résultats de l’étude sont présentés dans le tableau ci-dessous.