The basics of 2D DIGE

Kaksiulotteisen (2D) geelielektroforeesin tekniikka on tehokas väline monimutkaisten proteiiniseosten erottamiseen, mutta 1970-luvun puolivälissä tapahtuneesta käyttöönotostaan lähtien se on saanut leiman siitä, että se on erittäin vaikea sovellus hallita, ja sitä ovat yleensä käyttäneet parhaalla mahdollisella tavalla asiantuntijat. Kaupallisesti saatavilla olevien immobilisoitujen pH-gradienttien käyttöönotto 1990-luvun alussa paransi toistettavuutta ja helpotti protokollia, mikä johti tekniikan suosion selvään kasvuun. Geelien välistä vaihtelua oli kuitenkin edelleen vaikea hallita ilman teknisiä toistoja. Jon Mindenin ryhmä toteutti 1990-luvun puolivälissä (samaan aikaan kuin ”proteomiikan” synty) konseptin fluoresoivasti leimattujen proteiinien multipleksoinnista 2D-geelierotusta varten, ja se on johtanut kykyyn suunnitella kokeita siten, että geelistä toiseen tapahtuva vaihtelu voidaan käytännössä eliminoida, minkä ansiosta biologisia toistoja voidaan käyttää tilastolliseen analyysiin ja havaita hyvin pieniä muutoksia proteiinien suhteellisessa runsaudessa. Tätä tekniikkaa kutsutaan 2D-erogeelielektroforeesiksi (2D DIGE).