HemOnc: A new standard vocabulary for chemotherapy regimen representation in the OMOP common data model

Havainnointitietojen systemaattinen soveltaminen syöpähoitojen vaikutusten ymmärtämiseksi edellyttää yksityiskohtaisia tietomalleja, jotka mahdollistavat mielekkäät vertailut hoitomuotojen välillä. Valitettavasti systeemisiä hoitoja koskevia yksityiskohtia on rekistereissä ja tietovarastoissa niukasti, mikä johtuu pääasiassa protokollien monimutkaisuudesta ja standardoinnin puutteesta. Vuodesta 2011 lähtien olemme luoneet kemoterapiahoitojen kuratoitua ja puolistrukturoitua verkkosivustoa HemOnc.org. Yhteistyössä Observational Health Data Sciences and Informatics (OHDSI) Oncology Subgroup -ryhmän kanssa olemme muuttaneet huomattavan osan tästä sisällöstä OMOP:n yhteiseen tietomalliin, jossa on sidoksia useisiin ulkoisiin sanastoihin, kuten RxNormiin ja National Cancer Institute Thesaurukseen. Tällä hetkellä koko sanastossa on >73 000 käsitettä ja >177 000 suhdetta. Kemoterapiaohjelmien määrittelyyn ja koostumukseen liittyvä sisältö on julkaistu ATHENA-työkalussa (athena.ohdsi.org) OHDSI:n jäsenistön laajamittaista käyttöä varten. Tässä kuvataan HemOnc-sanaston perusteita, tietomallia ja alustavaa sisältöä sekä useita käyttötapauksia, joissa se voi olla arvokas.