Flokki (biofilmi)

Flokki on eräänlainen mikrobien aggregaatti, joka voidaan erottaa biofilmeistä ja rakeista tai sitä voidaan pitää erikoistuneena biofilmityyppinä. Flokit esiintyvät sameina solususpensioina, jotka kelluvat vedessä sen sijaan, että ne olisivat kiinnittyneet pintaan ja kasvaisivat siihen, kuten useimmat biofilmit. Flokkia pitää yleensä koossa solunulkoisen polymeerisen aineen (EPS) matriisi, joka voi sisältää vaihtelevia määriä polysakkarideja, proteiineja ja muita biopolymeerejä. Flokkien muodostuminen ja ominaisuudet voivat vaikuttaa teollisen vedenkäsittelyn bioreaktoreiden, kuten aktiivilietesysteemien, suorituskykyyn, kun flokit muodostavat lietepeitteen.

Flokkien muodostuminen voi hyödyttää niihin kuuluvia mikro-organismeja monin tavoin, kuten suojaamalla pH-stressiltä, vastustuskyvyllä saalistusta vastaan, manipuloimalla mikroympäristöjä ja helpottamalla mutualistisia suhteita sekoittuneissa mikrobiyhteisöissä.

Yleisesti ottaen mekanismeja, joiden avulla flokkuloituvat mikrobiaggregaatit pysyvät koossa, ymmärretään huonosti. Aktiivilietebakteeria Zoogloea resiniphila koskeva työ on kuitenkin osoittanut, että PEP-CTERM-proteiinien on ilmentynyttävä, jotta flokkeja muodostuisi; niiden puuttuessa kasvu on planktonista, vaikka eksopolysakkaridia tuotetaankin.

Zoogloea resiniphilan kaksi kantaa. Vasemmalla olevassa putkessa näkyy tyypillisiä flokkimuodostumia aktiivilietteisestä jätevedenpuhdistusreaktorista eristetyn Zoogloea resiniphila -bakteerin muuten kirkkaassa viljelyssä. Oikeanpuoleisessa putkessa flokkihäiriöisen mutantin planktoninen kasvu johtaa sameaan ulkonäköön.