EcoCyc: coli-geenien ja aineenvaihdunnan tietosanakirja

EcoCyc on elektroninen hakuteos biologeille, jotka työskentelevät E. colin ja siihen liittyvien mikro-organismien parissa. BioCyc-tietokantakokoelmaan kuuluva EcoCyc on bioinformatiikan tietokanta, joka kuvaa Escherichia coli K-12 MG1655:n genomia, metaboliaverkostoa ja säätelyverkostoa.

EcoCyc-tiedot on johdettu kirjallisuuteen perustuvasta kuratoinnista, joka koskee E. colin koko genomia, transkriptionaalista säätelyverkostoa, siirtäjiä ja aineenvaihduntareittejä. Hankkeen pitkän aikavälin tavoitteena on helpottaa E. colin systeemitason ymmärtämistä luetteloimalla solun molekyylikomponentit ja niiden toiminnot.

EcoCyc-verkkosivusto tukee useiden E. coli -kantojen vertailevia analyysejä ja suurten läpimenoaikojen datan analysointia.

Kuvailtua hanketta on tukenut National Institute of General Medical Sciencesin myöntämä apuraha numero U24GM077678. Sisältö on yksinomaan kirjoittajien vastuulla, eikä se välttämättä edusta National Institute of General Medical Sciencesin tai National Institutes of Healthin virallisia näkemyksiä.