DNA Land arvostelu – Maailman suurin sukupuu?

Toimittanut Christina Swords, Ph.D.

7 faktaa DNA Land -katsauksestamme

1. Sijainti: DNA Land: DNA.landiin ladattavat DNA-tiedot piirre- ja esi-isäanalyysiä varten
2. Raportit: esi-isien erittely, sukulaislöytö, useita piirre-raportteja
3. Raporttien toimittaminen: Piirre-raportit toimitetaan verkkosivuston kautta
4. Kustannukset:
5. Yksityisyys: aikoo käyttää kerättyjä geneettisiä tietoja tieteellisiin tutkimushankkeisiin
6. Vaihtoehtoja:

DNA Land Johdanto

Tämä on katsaus DNA Landiin, yritykseen, joka kerää genomitietoja käyttäjiltä tieteellisen tietokannan rakentamiseksi tutkimusta varten. Sen perusti vuonna 2015 ryhmä tutkijoita New Yorkin genomikeskuksesta ja Columbian yliopistosta. Vuonna 2019 yritys lopetti toimintansa akateemisen laitoksen verkkosivustona ja käynnistyi uudelleen voittoa tavoittelevana yrityksenä.

Ryhmään kuuluvat edelleen sen perustajajäsenet: Tohtori Yaniv Erlich, Dina Zielinski ja Assaf Gordon. Tiukkojen ihmisiin kohdistuvien koehenkilösäännösten vuoksi he poistivat kaikki 30. syyskuuta 2019 asti kerätyt tietokokonaisuudet.

DNA Land teki vuonna 2017 yhteistyötä National Breast Cancer Coalitionin (NBCC) kanssa ymmärtääkseen paremmin rintasyövän geneettistä riskiä. Lisäksi Elrich käyttää DNA Landin ja Geni.com-sivuston tietoja rakentaakseen maailman suurimman sukupuun.

Oletko kiinnostunut oppimaan lisää uusimmista geneettisistä löydöksistä ja siitä, miten ne koskevat sinun DNA:siasi? Nebula Genomics tarjoaa koko genomin sekvensointia, joka purkaa 100 % DNA:stasi. Sen avulla voimme toimittaa sinulle viikoittain päivitettyjä raportteja, jotka antavat sinulle mahdollisuuden pysyä tieteen kärjessä! Klikkaa tästä saadaksesi lisätietoja!

DNA-maa-palvelu

Mikä on DNA-maa? Vapaaehtoisten on luotava tili DNA Land -tunnuksilla ja allekirjoitettava 1500 sanan mittainen suostumuslomake. Siinä kuvataan myös yksinkertaisesti geneettisten tietojen jakamiseen liittyvät riskit ja hyödyt ilman juridista jargonia.

Sivustolla kerätään tietoja, kuten sähköpostiosoitteita, genomitietoja, demografisia perustietoja osallistujasta ja lähisuvusta sekä piirteitä. Ne tallentavat myös fenotyyppejä tarjoamalla kyselylomakkeita, joissa käsitellään fyysisiä ja terveydellisiä piirteitä. Kukin kyselylomake koskee yhtä ominaisuutta, ja käyttäjät voivat valita, mitkä kyselylomakkeet he täyttävät.

Yhtiö tarjoaa ilmaisia palveluja kannustimina käyttäjille, jotka käyttävät DNA Landia ja lataavat raakatietoja. Näitä ovat (i) esi-isien koostumusraportti, (ii) sukulaisten etsijä ja (iii) mielenkiintoisten fyysisten ja hyvinvointipiirteiden ennustaminen. Se myös imputoi geneettistä tietoa, jonka avulla käyttäjät voivat löytää geneettisiä variaatioita, jotka eivät sisältyneet alkuperäiseen tiedostoon.

Yhtiö lupaa myös lisätä tulevaisuudessa lisää ainutlaatuisia ominaisuuksia verkkosivustolleen.

Review of DNA Land Reporting

Aloitat lataamalla tiedot verkkosivustolle. Sivusto tarjoaa raportteja syntyperästä, sukulaisista, ominaisuuksista ja rankaisemattomuudesta, jos lataat raa’an DNA-tiedostosi.

Review of DNA Land Ancestry Report

Esi-isien löytämiseksi he käyttävät yli 6000 yksilöstä koostuvaa referenssipaneelia, joka on järjestetty 40 populaatioon (mukaan lukien intiaanit). He käyttävät ”Ancestry”-ohjelmaa etsiäkseen yhtäläisyyksiä käyttäjän DNA-koostumuksen ja vertailupopulaatioiden yksilöiden välillä.

Taustaraportti antaa erittelyn siitä, mistä geenit ovat peräisin (kuva 1a). Se arvioi etnisen alkuperän ja antaa kartan lähimpien DNA-tapausten sijainneista. Syntyperätaulukoiden lisäksi tarjotaan kartta, jossa näkyvät yhteensovitetut vertailupopulaatiot eri puolilla maailmaa (kuvat 1b,c).

Mukana on myös varsinainen jaottelu kustakin raporttiin sisällytetystä tai siitä pois jätetystä väestöstä. Nämä sisältävät myös lisätietoja näiden ryhmien geneettisestä koostumuksesta (kuva 1d).

Kuvio 1d: Kunkin mukaan otetun ja mukaan ottamatta jätetyn väestön todellinen jakautuminen.

Review of DNA Land Relative Finder Report

Käyttäjät voivat myös löytää lähimmät sukulaisensa sen jälkeen, kun he ovat ladanneet genomitietonsa. Palvelu laskee jaetun DNA:n samankaltaisuuden eri sukulaisten kanssa. Näissä laskelmissa käytetään jaettujen DNA-segmenttien lukumäärää ja jaetun DNA:n kokonaispituutta vastaavuuksien määrittämiseksi. Raportti sisältää myös visualisoinnin jaetuista segmenteistä.

Katselu DNA Landin ominaisuuksien ennustamisraportista

DNA Land raportoi yksittäisiksi nukleotidipolymorfismeiksi (SNP) kutsuttujen geneettisten variaatioiden ja biologisten ominaisuuksien välisistä yhteyksistä. Ennustetut piirteet luokitellaan hyvinvointiin (kronotyyppi, kahvin kulutus, koulutus) ja fyysisiin (silmien väri, pituus ja likinäköisyys).

Jokainen raportti ennustaa ominaisuuden, joka perustuu käyttäjän genomitietoihin. Se myös vertaa todennäköisyyspistemäärää tietokannassa saatavilla oleviin tietoihin.

Käyttäjät suorittavat ensin kyselyn ennen kuin he saavat ennusteen DNA-tulokset. Näin käyttäjät voivat testata verkkosivuston tekemien ennusteiden tarkkuutta.

Kyselystä annetaan esimerkki:

DNA Landin genomitietoihin perustuvan raportin tuottamassa raportissa on kolme osa-aluetta.

Raportin ensimmäisestä osiosta käy ilmi, kuinka todennäköinen tietty sairaus on käyttäjillä tunnettujen geneettisten varianttien perusteella. Esimerkkinä tästä voisi olla, että tunnettujen geneettisten varianttien avulla voidaan päätellä, että olet todennäköisesti aamuihminen. Grafiikka näyttää myös, miten tätä ennustetta verrataan muihin käyttäjiin.

Seuraavaksi yritys ilmoittaa yksityiskohtaisesti, mitkä geneettiset variantit tai SNP:t (Single Nucleotide Polymorphisms, yksittäiset nukleotidipolymorfismit) vaikuttavat piirteen ennustettuun tulokseen. Mukana on myös se, kuinka suuri tämä osuus on. Käyttäjät voivat myös havainnollistaa näiden SNP:iden sijainnit kromosomeissa tutkimalla efektikokojen kuvaajaa.

Viimeiseksi raportissa taulukoidaan analyysin merkittävimmät SNP:t. Nämä tiedot sisältävät yksityiskohtaisen erittelyn tukevasta tutkimuksesta. Siihen sisältyy kunkin SNP:n vaikutus ja geenit, joissa variantit sijaitsevat.

Nämä ovat mielenkiintoisia tietoja, joita genomitiedoista on saatavilla, kun tutkitaan geneettistä osuutta ihmisten ominaisuuksiin. Tiettyjen SNP:iden sijainnit voivat viitata geneettiseen kontribuutioon ominaisuutta kohtaan.

DNA Landin hinnoittelu

Kaikki yrityksen tarjoamat palvelut ovat ilmaisia. Käyttäjät saavat raporttinsa käyttöönsä muutaman tunnin tai päivän kuluessa sen jälkeen, kun he ovat ladanneet genomitietonsa. Lisäraportteja voi saada täyttämällä lyhyitä kyselyitä, jotka auttavat tutkijoita heidän tutkimuksissaan.

Review of DNA Land Privacy

Suostumusehdot takaavat sen käyttäjille täydellisen yksityisyyden henkilökohtaisten tietojen, yksittäisten tutkimustulosten tai minkä tahansa ladatun käyttäjätiedon osalta. Käyttäjät voivat yhdistää sosiaalisen median profiilejaan verkkosivustoon, mutta yritys ei jaa tietoja.

Yhtiö voi jakaa henkilötietoja valittujen kumppaneiden kanssa, jotka noudattavat hyviä turvallisuuskäytäntöjä, kunnioittavat suostumusta ja noudattavat sääntelyä. Käyttäjät voivat kieltäytyä tästä vaihtoehdosta, vaikka henkilötietoja voidaan luovuttaa, jos laki sitä vaatii.

Käyttäjät, jotka yhdistävät Geni.com-tilejään (verkkosivusto sukupuiden rakentamiseen), voivat löytää tietoja muista käyttäjistä, joilla on linkitetyt tilit.

Yhtiö poisti tallennetut tiedot akateemisessa versiossa, kun niistä tuli kaupallisia vuonna 2019.

DNA Land uutisissa

Yhtiö on nauttinut runsaasti medianäkyvyyttä, enimmäkseen ennen kuin se on eronnut Kolumbian yliopistosta ja New Yorkin Genomikeskuksesta. He ovat myös julkaisseet käyttäjädataa hyödyntäviä geneettisiä löydöksiään arvostetuissa lehdissä, kuten Nature Genetics ja eLife.

• The Crowdsourcing Site That Wants to Pool Our Genomes
• Crowdsourced genomic resource DNA Land relaunch company
• Tutkijat toivovat houkuttelevansa miljoonia ihmisiä DNA Landiin

Yaniv Erlich piti vuonna 2018 Ted-puheenvuoron, jossa hän kertoi, miten hän rakensi maailman suurimman sukupuun DNA Landin ja Genin tietojen avulla.com.

Juuri äskettäin DNA Land on tehnyt yhteistyötä Luna DNA:n kanssa, joka mahdollistaa sen osallistumisen tutkimukseen ja korvauksen saamisen. Tutustu Luna DNA:n arvosteluun!

DNA Landin arvostelut

Miten tarkka DNA Land on? Useiden DNA Land Reddit-ketjujen perusteella käyttäjät ovat pitäneet 23andMe:tä luotettavampana tarkkuuden suhteen. Yleinen positiivinen palaute johtuu kuitenkin siitä, että se on ilmainen palvelu ja tarjoaa ainutlaatuisia geneettisiä ominaisuuksia, jotka ovat erityisen kiinnostavia geneettisille sukututkijoille. Joitakin arvosteluja ovat :

”Parempi käyttäjien yksityisyys kuin GEDMatchilla. Käyttäjäystävällisempi. Heidän muinainen vs. äskettäinen DNA-analyysinsä on hyödyllinen määritettäessä, onko henkilö äskettäinen vai kaukainen vastine. Tohtori Yaniv Erlich vastaa palautteeseen ja on hyvin mukana geneettisen sukututkimuksen yhteisössä. Toivoisin vain, että sillä olisi enemmän käyttäjiä.”

”Se on ilmainen, mutta DNA-täsmäys ei ole loistava, ja tietokanta on pieni. Sivustolla on minulle osumia, jotka ovat myös muilla sivustoilla, mutta cm-lukujen ollessa hullun korkeita.”

Sivuston uudesta kaupallisesta versiosta ei ole vielä paljon arvosteluja.”

Hyvät ja huonot puolet

Hyvät puolet

• Suurin hyvä puoli DNA Landissa on se, että sen palvelut ovat ilmaisia.”
• Raportointiominaisuuksiin on tehty jatkuvasti parannuksia, jotka mahdollistavat entistä yksityiskohtaisempien ja visuaalisesti miellyttävämpien sukututkimusraporttien laatimisen.
• Erikoisia ominaisuuksia, kuten imputaatio (tilastollisen päättelyn käyttäminen tuntemattomien genotyyppien päättelemiseksi tunnettujen genotyyppien perusteella) ja jaetut geneettiset segmentit.
• Käyttäjät näyttävät löytäneen enemmän sukulaisia kuin muut testausyritykset myös.
• Käyttäjät tuntevat olevansa paremmin yhteydessä meneillään olevaan geneettiseen tutkimukseen luovuttamalla genomitietonsa.

Miinukset

• Pieni genomitietokanta.
• Ancestry and trait results were not found to be as accurate when compared to other testing companies.
• Many initial users found few or no matched relatives as other testing companies.

Vertailut

Lopetamme DNA Land -arvostelumme vertailuihin Nebula Genomicsiin ja muihin geenitestiyrityksiin.

	DNA Land	23andMe	Ancestry DNA	Nebula Genomics
DNA-testaus	Käyttää muilta yrityksiltä saatuja raakatiedostoja.	Käyttää genotyypitystä sekvensoinnin sijaan.	Käyttää genotyypitystä sekvensoinnin sijaan.	Tarjoaa 30x koko genomin sekvensointia. Tarjoaa myös ilmaisen raa’an DNA-datan lataamisen
Datan latausvaihtoehdot	Vapaa DNA-raportti ladatuista tiedoista.	Ei datan latausvaihtoehtoja.	Ei datan latausvaihtoehtoja.	Vapaa laajennettu DNA-raportti käyttäjän ladatuista tiedoista
Viikoittain päivitettävä raportointi	Ei	Ei	Ei	Ei	Kyllä (lisätietoja)
Syväluotaava esi-isätietokanta (y-CHR- ja mtDNA-sekvensointi)	Ei	Ei	Ei	Ei	Syväluotauksen raportointi täydellisellä Y-kromosomin ja mtDNA:n sekvensoinnilla yhteistyössä FTDNA:n kanssa
Imputaatio	Sisältää imputoinnin raporttiin, joka on käsitelty käyttäjän lataamista tiedoista.	Ei. Imputointiin on käytettävä muita resursseja.	Ei. Pitää käyttää muita resursseja imputointiin.	Kyllä. Tarjoaa imputointitulokset laajennetuissa raporteissa

Muut DNA:n lataussivustot, joista teet kuten ovat:

• DNA Painter (sukututkimukseen – ensimmäinen on ilmainen ja muille on saatavilla tilauksia)
• GedMatch Genesis (ilmainen DNA-lataus ja maksulliset lisäasetukset)
• Genetic Genie (ilmainen terveysraportointi)
• LifeDNA (99 dollaria lataukseen ja terveysraportointiin, DNA-pakkaus ja päivitykset saatavilla lisämaksusta)
• Living DNA (ilmainen lataus sukututkimusta varten)
• MyHeritage (ilmainen lataus sukututkimusta varten)
• MyTrueAncestry (opi yhteytesi muinaisiin populaatioihin – ilmainen lataus – $397)
• WeGene (keskittyy aasialaisiin väestöihin, raporttien hinta)

Jos sinulla on koko genomin sekvensointitietoja, katso myös YFull ($25 – $49 Y-DNA:lle ja mtDNA:lle).

Jos olet kiinnostunut syntyperästä tai geneettisestä sukututkimuksesta, kannattaa katsoa myös:

• 23andMe (99 dollaria perushistoriallisesta testistä)
• African Ancestry (299 dollaria per sukulinja)
• AncestryDNA (99 dollaria perushistoriallisesta testistä)
• CRI Genetics (99 dollaria perushistoriallisesta testistä)
• DNA-Painter (1. profiili on ilmainen ja muille on saatavilla tilauksia)
• GedMatch Genesis (ilmainen DNA-lataus geneettistä sukututkimusta varten ja maksulliset edistyneemmät vaihtoehdot)
• Living DNA (alkaen $49)
• MyHeritage ($99 esi-isätestistä, lisätilaukset sukututkimustyökalujen käyttöön)
• WeGene (aasialaiseen syntyperään)

Katso myös GEDmatch-oppaamme, jotta opit käyttämään tätä tehokasta työkalua!

Jos etsit kotona tehtävää isyystestiä, kannattaa lukea myös arvostelumme HomeDNA:sta.

Jos haluat keskittyä äidin ja/tai isän sukulinjoihisi, voit tutustua YFull- tai YSeq-palveluihin, jotka analysoivat mtDNA:ta tai Y-kromosomia määrittääksesi tietyt sukulinjan haplotyypit. Full Genomes tarjoaa myös Y-kromosomin sekvensointia ja analyysiä. Saatat myös haluta tutustua etnisiin erityistesteihin, kuten afrikkalaisiin DNA-testeihin.

Tykkäsitkö DNA Land -arvostelustamme? Voit lukea lisää arvosteluja blogistamme ja tutustua täydelliseen oppaaseemme parhaista DNA-testipakkauksista ja muista kotitesteistä.