Los fundamentos de la DIGE 2D

La técnica de la electroforesis en gel bidimensional (2D) es una poderosa herramienta para separar mezclas complejas de proteínas, pero desde su creación a mediados de los años 70, adquirió el estigma de ser una aplicación muy difícil de dominar y, por lo general, era utilizada de forma óptima por expertos. La introducción de gradientes de pH inmovilizados disponibles en el mercado a principios de la década de 1990 proporcionó una mayor reproducibilidad y protocolos más sencillos, lo que condujo a un pronunciado aumento de la popularidad de la técnica. Sin embargo, la variación entre geles seguía siendo difícil de controlar sin el uso de réplicas técnicas. A mediados de la década de 1990 (al mismo tiempo que el nacimiento de la «proteómica»), el grupo de Jon Minden puso en práctica el concepto de multiplexación de proteínas marcadas con fluorescencia para la separación de geles en 2D y ha permitido diseñar experimentos para eliminar prácticamente la variación entre geles, lo que ha dado lugar a que se utilicen réplicas biológicas para el análisis estadístico con la capacidad de detectar cambios muy pequeños en la abundancia relativa de proteínas. Esta tecnología se denomina electroforesis en gel diferencial 2D (2D DIGE).