EcoCyc: Encyclopedia of E. coli genes and metabolism

EcoCyc ist eine elektronische Referenzquelle für Biologen, die mit E. coli und verwandten Mikroorganismen arbeiten. Als Mitglied der BioCyc Database Collection ist EcoCyc eine bioinformatische Datenbank, die das Genom, das metabolische Netzwerk und das regulatorische Netzwerk von Escherichia coli K-12 MG1655 beschreibt.

EcoCyc-Daten stammen aus einer literaturbasierten Kuration des gesamten Genoms, des transkriptionellen regulatorischen Netzwerks, der Transporter und der Stoffwechselwege von E. coli. Langfristiges Ziel des Projekts ist es, ein Verständnis von E. coli auf Systemebene zu ermöglichen, indem die molekularen Komponenten der Zelle und ihre Funktionen katalogisiert werden.

Die EcoCyc-Website unterstützt vergleichende Analysen mehrerer E. coli-Stämme und die Analyse von Hochdurchsatzdaten.

Das beschriebene Projekt wurde durch den Zuschuss Nr. U24GM077678 des National Institute of General Medical Sciences unterstützt. Der Inhalt liegt in der alleinigen Verantwortung der Autoren und gibt nicht unbedingt die offiziellen Ansichten des National Institute of General Medical Sciences oder der National Institutes of Health wieder.