HemOnc: En ny standardordliste for repræsentation af kemoterapiregimer i den fælles OMOP-datamodel
Systematisk anvendelse af observationsdata til forståelse af virkningerne af kræftbehandlinger kræver detaljerede informationsmodeller, der gør det muligt at foretage meningsfulde sammenligninger mellem behandlingsregimer. Desværre er detaljer om systemiske behandlinger sjældne i registre og datalagre, primært på grund af protokollernes komplekse karakter og manglende standardisering. Siden 2011 har vi oprettet et kurateret og semistruktureret websted for kemoterapiregimer, HemOnc.org. I samarbejde med Observational Health Data Sciences and Informatics (OHDSI) Oncology Subgroup har vi transformeret en væsentlig delmængde af dette indhold til den fælles OMOP-datamodel med bindinger til flere eksterne vokabularer, f.eks. RxNorm og National Cancer Institute Thesaurus. I øjeblikket er der >73.000 begreber og >177.000 relationer i det fulde ordforråd. Indhold relateret til definitionen og sammensætningen af kemoterapiregimer er blevet frigivet i ATHENA-værktøjet (athena.ohdsi.org) med henblik på udbredt anvendelse af OHDSI-medlemmerne. Her beskriver vi begrundelsen, datamodellen og det indledende indhold af HemOnc-vokabulæret sammen med flere anvendelsestilfælde, som det kan være værdifuldt for.
Leave a Reply