Základy 2D DIGE

Technika dvourozměrné (2D) gelové elektroforézy je mocným nástrojem pro separaci složitých směsí proteinů, ale od svého vzniku v polovině 70. let 20. století získala stigma velmi obtížně zvládnutelné aplikace a většinou ji využívali odborníci. Zavedení komerčně dostupných imobilizovaných pH gradientů na počátku 90. let 20. století přineslo lepší reprodukovatelnost a jednodušší protokoly, což vedlo k výraznému nárůstu popularity této techniky. Nicméně odchylky mezi jednotlivými gely bylo stále obtížné kontrolovat bez použití technických replikátů. V polovině 90. let 20. století (ve stejné době, kdy se zrodila „proteomika“) byl skupinou Jona Mindena realizován koncept multiplexování fluorescenčně značených proteinů pro separaci na 2D gelu, který vedl k možnosti navrhovat experimenty tak, aby se prakticky eliminovala variabilita mezi jednotlivými gely, což vedlo k tomu, že se pro statistickou analýzu používají biologické replikáty se schopností detekovat velmi malé změny v relativním množství proteinů. Tato technologie se označuje jako 2D diferenční gelová elektroforéza (2D DIGE).