EcoCyc: coli a metabolismu

EcoCyc je elektronický referenční zdroj pro biology, kteří pracují s E. coli a příbuznými mikroorganismy. EcoCyc je členem BioCyc Database Collection a jedná se o bioinformatickou databázi, která popisuje genom, metabolickou síť a regulační síť Escherichia coli K-12 MG1655.

Data z EcoCyc jsou odvozena na základě literárně zpracované kurately celého genomu, transkripční regulační sítě, transportérů a metabolických drah E. coli. Dlouhodobým cílem projektu je usnadnit pochopení E. coli na systémové úrovni katalogizací molekulárních složek buňky a jejich funkcí.

Stránky EcoCyc podporují srovnávací analýzy více kmenů E. coli a analýzu vysoce výkonných dat.

Popisovaný projekt byl podpořen grantem číslo U24GM077678 Národního ústavu všeobecných lékařských věd. Za obsah odpovídají výhradně autoři a nemusí nutně vyjadřovat oficiální názory National Institute of General Medical Sciences nebo National Institutes of Health.