DNA Land recenze – Největší rodokmen na světě?

Zpracovala Christina Swords, Ph.D.

7 faktů z naší recenze DNA Land

1. Umístění: USA
2. Výrobky:
3. Zprávy: rozpis předků, vyhledávač příbuzných, několik zpráv o znacích
4. Dodání zpráv: zprávy o znacích jsou dodávány prostřednictvím webových stránek
5. Cena: 10 000 Kč: Zdarma
6. Ochrana osobních údajů: shromážděná genetická data hodlá použít pro vědecké výzkumné projekty
7. Alternativy: Společnost Nebula Genomics (bezplatná rozšířená analýza DNA; cenově nejdostupnější 30x sekvenování celého genomu)

DNA Land Úvod

Toto je recenze společnosti DNA Land, která shromažďuje údaje o genomu od uživatelů za účelem vytvoření vědecké databáze pro výzkum. Byla založena v roce 2015 skupinou výzkumníků z Newyorského genomového centra a Kolumbijské univerzity. V roce 2019 společnost ukončila činnost jako webová stránka akademické instituce a znovu zahájila činnost jako výdělečná společnost.

Tým stále tvoří její zakládající členové: Yaniv Erlich, Dina Zielinski a Assaf Gordon. Vzhledem k přísným předpisům týkajícím se lidských subjektů smazali všechny soubory dat, které shromáždili do 30. září 2019.

DNA Land v roce 2017 navázala spolupráci s organizací National Breast Cancer Coalition (NBCC) s cílem lépe porozumět genetickému riziku vzniku rakoviny prsu. Kromě toho společnost Elrich pracuje s daty ze společnosti DNA Land a webu Geni.com na vytvoření největšího rodokmenu na světě.

Máte zájem dozvědět se více o nejnovějších genetických objevech a o tom, jak se týkají vaší DNA? Společnost Nebula Genomics nabízí sekvenování celého genomu, které dekóduje 100 % vaší DNA. Umožní nám poskytovat vám každý týden aktualizované zprávy, které vám umožní zůstat na špici vědy! Klikněte zde a dozvíte se více!

Služba DNA Land

Co je to DNA Land? Dobrovolníci si musí vytvořit účet s přihlášením do služby DNA Land a podepsat formulář souhlasu o rozsahu 1500 slov. V něm jsou také jednoduše popsána rizika a výhody sdílení genetických údajů bez právního žargonu.

Na webových stránkách se shromažďují údaje, jako jsou e-mailové adresy, genomické údaje, základní demografické informace o účastníkovi a nejbližší rodině a znaky. Ukládají také fenotypy tím, že poskytují dotazníky zabývající se fyzickými a zdravotními znaky. Každý dotazník se týká jednoho znaku a uživatelé si mohou vybrat, které dotazníky vyplní.

Společnost poskytuje bezplatné služby jako pobídku pro uživatele, kteří využívají službu DNA Land a nahrávají nezpracované údaje. Patří mezi ně (i) zpráva o složení předků, (ii) vyhledávač příbuzných a (iii) předpověď zajímavých fyzických a wellness znaků. Rovněž imputuje genetické informace, což uživatelům umožňuje najít genetické odchylky, které nebyly součástí původního souboru.

Společnost také slibuje, že v budoucnu přidá na své webové stránky další jedinečné funkce.

Přehled zpráv DNA Land

Začínáte nahráním dat na webové stránky. Stránky poskytují zprávy o původu, příbuzných, znacích a beztrestnosti, pokud nahrajete svůj nezpracovaný soubor DNA.

Review of DNA Land Ancestry Report

Pro zjištění původu používají referenční panel více než 6000 jedinců uspořádaných do 40 populací (včetně původních obyvatel Ameriky). Pomocí programu „Ancestry“ hledají podobnosti složení DNA uživatele s jedinci v referenčních populacích.

Ve zprávě o předcích je uvedeno rozdělení podle místa původu genů (obr. 1a). Odhaduje etnickou příslušnost a uvádí mapu míst nejbližších shod DNA. Kromě tabulek předků je nabízena mapa zobrazující shodné referenční populace na celém světě (obr. 1b,c).

Přiložen je také aktuální rozpis jednotlivých populací zahrnutých nebo vyloučených ze zprávy. Ty obsahují i další informace o genetickém složení těchto skupin (obr. 1d).

Přehled zpráv vyhledávače DNA Land Relative Finder

Uživatelé mohou po nahrání genomických dat vyhledat také své nejbližší příbuzné. Služba vypočítá podobnost ve sdílené DNA s různými příbuznými. Tyto výpočty využívají počet sdílených segmentů DNA a celkovou délku sdílené DNA k určení vašich shod. Součástí zprávy je také vizualizace segmentů, které sdílíte.

Zpráva o predikci znaků DNA Land

Zpráva DNA Land informuje o souvislostech mezi genetickými variantami nazývanými jednonukleotidové polymorfismy (SNP) a biologickými znaky. Předpovídané znaky jsou rozděleny do kategorií wellness (chronotyp, konzumace kávy, vzdělání) a fyzické (barva očí, výška a krátkozrakost).

Každá zpráva předpovídá znak na základě genomických informací uživatele. Porovnává také skóre pravděpodobnosti s dostupnými informacemi v databázi.

Před obdržením výsledků predikce DNA uživatelé nejprve vyplní dotazník. To uživatelům umožňuje otestovat přesnost předpovědí provedených webovou stránkou.

Příklad průzkumu je uveden:

Zpráva vygenerovaná společností DNA Land na základě genomických údajů má tři složky.

První segment zprávy ukazuje, jak pravděpodobný je určitý stav pro uživatele na základě známých genetických variant. Příkladem může být, že na základě známých genetických variant lze usuzovat, že jste pravděpodobně ranní ptáče. Graf také ukazuje, jak je tato předpověď srovnatelná s ostatními uživateli.

Dále společnost podrobně popisuje, jaké genetické varianty nebo SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) přispívají k předpovězenému skóre dané vlastnosti. Součástí je také informace o tom, jak velký je tento příspěvek. Uživatelé mohou také vizualizovat umístění těchto SNP na chromozomech prozkoumáním grafu velikosti účinku.

Nakonec zpráva uvádí tabulky s nejvýznamnějšími SNP v analýze. Tyto informace obsahují podrobný rozpis z podpůrného výzkumu. Zahrnuje účinek jednotlivých SNP a geny, v nichž se varianty nacházejí.

Jedná se o zajímavé informace dostupné z dat genomu pro studium genetického příspěvku ke znakům u lidí. Umístění konkrétních SNP může naznačovat genetický příspěvek k danému znaku.

Ceník služby DNA Land

Všechny služby nabízené společností jsou zdarma. Uživatelé mají přístup ke svým zprávám během několika hodin až dnů po nahrání svých genomických dat. Další zprávy lze získat vyplněním krátkých dotazníků, které pomáhají výzkumníkům v jejich studiích.

Přehled soukromí společnosti DNA Land

Podmínky souhlasu zajišťují jejím uživatelům naprosté soukromí s ohledem na osobní údaje, výsledky jednotlivých průzkumů nebo jakékoli nahrané údaje uživatelů. Uživatelé mohou propojit své profily na sociálních sítích s webovými stránkami, ale tyto údaje společnost nesdílí.

Společnost může sdílet osobní údaje s vybranými partnery, kteří dodržují správné bezpečnostní postupy, respektují souhlas a dodržují předpisy. Uživatelé mohou tuto možnost odmítnout, ačkoli osobní údaje mohou být zveřejněny, pokud to vyžaduje zákon.

Uživatelé, kteří propojí své účty na Geni.com (webová stránka pro vytváření rodokmenů), mohou najít informace o dalších uživatelích s propojenými účty.

Společnost smazala uložené údaje v akademické verzi, když se v roce 2019 staly komerčními.

DNA Land ve zprávách

Společnost se těšila hojné medializaci, hlavně před oddělením od Kolumbijské univerzity a newyorského centra pro genom. Své genetické poznatky využívající uživatelská data publikovali také v uznávaných časopisech, jako jsou Nature Genetics a eLife.

• The Crowdsourcing Site That Wants to Pool Our Genomes
• Crowdsourcingový genomický zdroj DNA Land obnovil činnost společnosti
• Vědci doufají, že do DNA Land přilákají miliony lidí

Janiv Erlich měl v roce 2018 přednášku v TEDu o sestavování největšího rodokmenu na světě s využitím informací z DNA Land a Geni.com.

Nedávno společnost DNA Land navázala spolupráci se společností Luna DNA, která jí umožňuje přispívat na výzkum a dostávat za to odměnu. Podívejte se na naši recenzi společnosti Luna DNA!

Recenze společnosti DNA Land

Jak přesná je společnost DNA Land? Z několika vláken na Redditu o společnosti DNA Land vyplývá, že uživatelé považují společnost 23andMe za spolehlivější, pokud jde o přesnost. Obecně však existují pozitivní ohlasy díky tomu, že se jedná o bezplatnou službu a poskytuje jedinečné genetické funkce, které jsou zajímavé zejména pro genetické genealogy. Některé recenze jsou :

„Lepší soukromí uživatelů než GEDMatch. Uživatelsky přívětivější. Jejich analýza staré vs. nedávné DNA je užitečná při určování, zda se jedná o nedávnou nebo vzdálenou shodu. Dr. Yaniv Erlich reaguje na zpětnou vazbu a je velmi zapojen do komunity genetické genealogie. Jen bych si přál, aby měl více uživatelů.“

„Je to zdarma, ale shoda DNA není skvělá a databáze je malá. Mají tam pro mě shody, které jsou i na jiných stránkách, ale s čísly cm, která jsou šíleně vysoká.“

Na novou komerční verzi webu zatím není mnoho recenzí.

Klady a zápory

Klady

• Největším kladem pro DNA Land je to, že její služby jsou zdarma.
• Pokračující zlepšování funkcí hlášení podrobnější a vizuálně přitažlivější zprávy o předcích.
• Jedinečné funkce, jako je imputace (použití statistického odvozování k odvození neznámých genotypů na základě známých) a sdílené genetické segmenty.
• Zdá se, že uživatelé našli také více příbuzných než jiné testovací společnosti.
• Poskytnutím svých genomických informací se uživatelé cítí více zapojeni do probíhajícího genetického výzkumu.

Nevýhody

• Malá genomická databáze.
• Výsledky předků a znaků nebyly shledány tak přesnými ve srovnání s jinými testovacími společnostmi.
• Mnoho prvních uživatelů našlo jen málo nebo žádné shodné příbuzné jako jiné testovací společnosti.

Srovnání

Naší recenzi společnosti DNA Land zakončíme srovnáním se společností Nebula Genomics a dalšími společnostmi zabývajícími se genetickým testováním.

	DNA Land	23andMe	Ancestry DNA	Nebula Genomics
Testování DNA	Používá surové datové soubory získané od jiných společností.	Používá genotypování místo sekvenování.	Používá genotypování místo sekvenování.	Nabízí 30x sekvenování celého genomu. Nabízí také bezplatné nahrávání nezpracovaných dat DNA
Možnosti nahrávání dat	Zdarma zpráva o DNA z nahraných dat.	Žádné možnosti nahrávání dat.	Žádné možnosti nahrávání dat.	Zdarma rozšířený report DNA z nahraných uživatelských dat
Týdenní aktualizovaný report	Ne	Ne	Ne	Ne	Ano (dozvědět se více)
Hluboká ancestrie (Y-.CHR a sekvenování mtDNA)	Ne	Ne	Ne	No	Hluboké hlášení předků s kompletním sekvenováním chromozomu Y a mtDNA ve spolupráci s FTDNA
Imputace	Zahrnuje imputace ve zprávě zpracované z dat nahraných uživatelem.	Ne. Pro imputaci je třeba použít jiné zdroje.	Ne. Pro imputaci je třeba použít jiné zdroje.	Ano. Poskytuje výsledky imputace v rozšířených zprávách

Další stránky pro nahrávání DNA, které se vám líbí, jsou:

• DNA Painter (pro genealogii – první je zdarma a pro ostatní je k dispozici předplatné)
• GedMatch Genesis (bezplatné nahrávání DNA a placené pokročilé možnosti)
• Genetic Genie (zdarma pro zdravotní zprávy)
• LifeDNA (99 USD pro nahrávání a zdravotní zprávy, za příplatek je k dispozici sada DNA a aktualizace)
• Living DNA (bezplatné nahrávání pro předky)
• MyHeritage (bezplatné nahrávání pro genealogii)
• MyTrueAncestry (poznejte své spojení s dávnými populacemi – bezplatné nahrávání – 397 USD)
• WeGene (zaměření na asijské populace, cena zpráv)

Pokud máte data ze sekvenování celého genomu, podívejte se také na YFull (25 – 49 USD pro Y-DNA a mtDNA).

Pokud se zajímáte o předky nebo genetickou genealogii, měli byste se také podívat na:

• 23andMe (99 dolarů za základní test předků)
• African Ancestry (299 dolarů za rodokmen)
• AncestryDNA (99 dolarů za test předků)
• CRI Genetics (99 dolarů za test předků)
• DNA Painter (1. profil je zdarma a pro další je k dispozici předplatné)
• GedMatch Genesis (bezplatné nahrání DNA pro genetickou genealogii a placené pokročilé možnosti)
• Living DNA (od 49 USD)
• MyHeritage (99 USD za test předků, další předplatné pro přístup ke genealogickým nástrojům)
• WeGene (pro asijské předky)

Také se podívejte na náš návod GEDmatch, kde se dozvíte, jak tento výkonný nástroj používat!

Pokud hledáte domácí test otcovství, měli byste si také přečíst naši recenzi HomeDNA.

Pokud se chcete zaměřit na své mateřské a/nebo otcovské linie, můžete se podívat na YFull nebo YSeq, služby, které analyzují mtDNA nebo chromozom Y a určují konkrétní haplotypy linií. Full Genomes nabízí také sekvenování a analýzu chromozomu Y. Můžete se také podívat na testy specifické pro jednotlivá etnika, například testy africké DNA.

Líbila se vám naše recenze DNA Land? Další recenze si můžete přečíst na našem blogu a podívat se na našeho kompletního průvodce nejlepší sadou pro testování DNA a dalšími domácími testy.