D-Aminokyseliny v bílkovinách: Zrcadlo života jako molekulární index stárnutí

Bílkoviny jsou složeny výhradně z l-aminokyselin. U starších osob však byly nalezeny zbytky kyseliny d-asparagové (d-Asp) v oční čočce a mozku i v dalších tkáních. Přítomnost d-Asp může změnit strukturu bílkovin vyššího řádu, což může mít vliv na poruchy související s věkem, jako je katarakta a Alzheimerova choroba. d-Asp vzniká spontánní racemizací zbytků Asp v citlivých bílkovinách. Během stárnutí dochází k neenzymatické izomerizaci přirozených zbytků lα-Asp v bílkovinách prostřednictvím sukcinimidylového meziproduktu na l-β-, d-α- a d-β-izomery. Tato izomerizace neprobíhá rovnoměrně, ale dochází k ní u specifických zbytků, které jsou vzhledem ke své sekvenci nebo strukturnímu kontextu k izomerizaci náchylné. Proto je nutné stanovit povahu každého jednotlivého zbytku Asp v citlivých proteinech. Nedávno byla popsána nová metoda založená na LC-MS/MS pro analýzu isomerizace Asp na specifických místech proteinu. V tomto přehledu nejprve ukážeme, že homochiralita aminokyselin v proteinech není zaručena po celý život. Poté popisujeme vývoj nové metody pro analýzu d-aminokyselin vázaných na proteiny a diskutujeme negativní vliv, který má d-Asp na strukturu a funkci proteinů.

.